Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  308  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
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1
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.1
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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24
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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3.0
30
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15
16
10
1.65
92897340--92897419
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
92897351--92897428
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
92900380--92900551
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
92900372--92900547
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
92906752--92906785
17
2.1
15
89
10
50
0
11
0
88
0.52
92918392--92918435
22
2.0
22
95
0
79
27
15
15
40
1.88
92922347--92922426
27
3.0
27
88
0
115
32
10
22
35
1.87
92922353--92922446
27
3.5
27
80
0
71
31
11
21
35
1.89
92922890--92922931
15
2.8
16
82
10
61
69
0
4
26
1.08
92923041--92923070
15
2.0
15
93
0
51
76
0
20
3
0.92
92924288--92924334
24
2.0
22
84
8
58
44
6
14
34
1.71
92926102--92926140
19
2.1
19
85
9
53
33
5
10
51
1.58
92926165--92926203
15
2.6
14
84
11
51
30
2
0
66
1.05
92926166--92926212
20
2.3
20
85
7
60
31
2
2
63
1.18
92930035--92930101
25
2.7
25
76
0
62
17
28
14
38
1.90
92930110--92930179
25
2.8
24
80
4
77
28
27
15
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92930092--92930192
50
2.0
49
81
14
118
27
26
15
29
1.96
92933223--92933353
66
2.0
66
98
0
253
32
15
9
42
1.78
92935210--92935264
24
2.4
24
81
6
60
49
7
3
40
1.48
92944321--92944372
18
2.9
17
77
11
59
50
30
0
19
1.48
92949058--92949099
21
1.9
23
85
9
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26
2
11
59
1.45
92950918--92950957
19
2.0
22
85
14
59
32
47
2
17
1.61
92951019--92951133
27
4.3
26
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5
131
36
23
22
17
1.95
92951019--92951133
54
2.1
54
85
3
151
36
23
22
17
1.95
92952751--92952860
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
34
1.76
92954622--92954655
15
2.3
15
89
0
50
35
17
8
38
1.81
92955390--92955443
26
2.2
23
81
15
56
62
3
1
31
1.23
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45
5.0
45
84
3
259
24
21
27
26
1.99
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45
3.6
45
88
1
236
24
23
26
26
2.00
92978580--92978620
3
13.7
3
100
0
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0
0
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0
21
2
75
0.93
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23
1.9
22
90
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0
23
4
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1.04
92980754--92980804
26
2.0
26
84
7
68
0
25
3
70
1.04
92980816--92980853
16
2.5
15
91
8
60
34
0
0
65
0.93
92980816--92980853
5
7.6
5
88
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51
34
0
0
65
0.93
92981453--92981487
16
2.2
16
94
0
61
40
14
0
45
1.45
92981612--92981637
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
92982298--92982351
16
3.4
16
81
0
72
33
25
3
37
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92983267--92983295
11
2.7
11
94
5
51
86
0
0
13
0.58
92983615--92983653
8
4.9
8
96
0
69
53
0
46
0
1.00
92983602--92983669
19
3.8
17
70
19
50
63
0
36
0
0.95
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14
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14
75
14
64
68
0
31
0
0.90
92983710--92983767
19
3.4
17
76
17
50
65
0
34
0
0.93
92984205--92984263
30
1.9
31
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3
102
67
0
5
27
1.11
92984215--92984470
135
1.9
133
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4
327
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6
8
28
1.54
92984482--92984528
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10
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0
2
23
0.93
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18
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69
5
5
19
1.29
92984350--92985242
294
3.0
297
84
7
1056
56
6
7
29
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345