Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15983708--15983764
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2.8
21
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19
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3
0
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1.10
15983711--15983783
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3.8
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80
10
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1
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1.19
15983712--15983783
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19
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9
65
27
4
1
66
1.18
15983733--15983793
20
3.1
20
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9
72
22
4
1
70
1.15
15984565--15984603
19
2.0
19
85
5
51
69
2
0
28
1.02
15998120--15998204
3
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72
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1
3
29
1.16
15998120--15998203
20
4.3
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17
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1
3
29
1.17
15998507--15998583
21
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1
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15998508--15998615
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2.3
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112
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1
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23
18
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3.1
176
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24
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132
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22
19
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26
25
19
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1.98
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25
24
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30
1.98
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2.9
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21
23
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20
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21
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1.96
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2.8
260
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20
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21
35
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1.9
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0
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2.4
16
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4
51
17
2
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51
1.59
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20
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42
8
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27
1.81
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32
1.9
32
100
0
122
39
19
6
34
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16019408--16019438
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12
100
0
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12
51
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9
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16022636--16022696
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1.9
32
96
0
113
39
21
6
32
1.79
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3
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3
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1
3
30
1.17
16025108--16025187
12
6.8
12
75
12
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65
1
3
30
1.18
16025516--16025612
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22
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14
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59
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1
7
1.31
16025512--16025594
22
3.7
22
78
9
87
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30
1
8
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0
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22
0
0
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50
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2.8
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17
27
27
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26
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26
26
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25
25
20
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20
2.8
20
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2
69
33
23
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26
1.95
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4.0
130
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5
460
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17
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1.94
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2.0
394
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16
28
26
1.97
16065437--16065524
21
4.1
22
75
10
92
35
23
23
17
1.95
16065442--16065523
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1.9
41
82
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101
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25
24
17
1.96
16065706--16065800
28
3.6
24
81
13
93
46
33
4
15
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16065720--16065803
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14
29
25
1.95
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17
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1.93
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23
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1.9
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16
1
50
1.55
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14
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21
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1.96
16101181--16101266
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22
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16112668--16112709
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2
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21
1.63
16114671--16114736
28
2.4
27
85
9
82
30
1
3
65
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16114671--16114937
24
10.4
26
66
12
97
29
6
5
58
1.47
16117298--16117332
16
2.3
15
90
5
52
62
2
2
31
1.24
16117447--16117506
23
2.9
20
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15
59
56
5
6
31
1.47
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25
8.9
25
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4
5
33
1.41
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30
2.9
30
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0
136
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6
48
25
1.73
16118956--16119122
87
1.9
88
85
3
230
37
20
15
26
1.92
16119078--16119488
75
5.5
74
86
4
524
31
19
17
31
1.95
16131249--16131283
16
2.3
15
90
5
52
62
2
2
31
1.24
16131474--16131543
2
36.5
2
73
18
51
54
1
4
40
1.29
16131488--16131620
25
5.6
25
72
14
102
54
3
6
36
1.40
16131470--16131618
47
3.1
47
77
9
140
55
2
5
36
1.37
16131470--16131618
48
3.1
46
77
11
129
55
2
5
36
1.37
16133654--16133720
21
3.2
21
81
12
93
35
5
10
47
1.62
16133665--16133733
20
3.4
20
82
11
86
33
10
8
47
1.68
16133654--16133733
41
2.0
41
89
0
124
33
8
10
47
1.68
16140922--16140970
20
2.4
20
80
13
55
44
0
2
53
1.12
16141320--16141378
30
2.0
30
86
6
84
49
0
0
50
1.00
16141312--16141402
35
2.6
35
71
6
87
51
0
0
48
1.00
16142657--16142741
3
27.7
3
77
9
82
67
2
4
25
1.23
16142769--16142801
17
1.9
17
88
11
50
66
0
9
24
1.20
16142896--16143131
3
76.7
3
67
12
79
61
3
6
28
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16143048--16143125
28
2.7
28
82
11
79
62
2
5
29
1.30
16143042--16143126
31
2.8
31
78
8
93
60
2
5
31
1.34
16143266--16143311
3
15.7
3
78
13
51
63
0
2
34
1.07
16144727--16144778
18
2.7
19
75
16
54
30
1
3
63
1.23
16145077--16145147
27
2.7
26
84
6
88
29
5
5
59
1.44
16145123--16145169
22
2.1
22
88
0
67
27
4
2
65
1.22
16151289--16151405
33
3.6
33
83
3
139
29
26
13
30
1.94
16151289--16151444
65
2.4
64
82
5
170
29
23
14
32
1.94
16151312--16151494
65
2.8
66
78
6
174
31
22
12
33
1.91
16151316--16151477
33
4.9
33
84
3
175
32
21
12
33
1.91
16151316--16151494
98
1.8
98
84
2
243
32
22
11
34
1.89
16158113--16158142
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
16163731--16163814
26
3.2
26
96
0
150
34
5
23
35
1.80
16169483--16169541
26
2.3
26
100
0
118
35
6
22
35
1.80
16169826--16169884
21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
16169855--16169914
26
2.4
24
83
8
75
28
0
3
68
1.05
16182649--16182687
19
2.1
19
85
0
51
61
23
7
7
1.49
16187135--16187435
46
6.7
46
87
6
413
38
15
24
21
1.92
16187086--16187391
84
3.5
84
93
3
486
36
16
24
22
1.94
16187696--16187742
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
16191102--16191253
67
2.2
68
80
10
177
31
15
30
22
1.95
16193502--16193784
62
4.6
62
95
0
503
36
6
8
49
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16195601--16195772
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
16195594--16195769
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
16198080--16198214
26
5.2
26
93
1
227
33
5
24
37
1.78
16198080--16198214
51
2.6
52
96
1
245
33
5
24
37
1.78
16199696--16199744
25
2.0
25
84
8
64
38
20
16
24
1.92
16203835--16203969
26
5.2
26
93
1
227
33
5
24
37
1.78
16203835--16203969
51
2.6
52
96
1
245
33
5
24
37
1.78
16205448--16205496
25
2.0
25
84
8
64
38
20
16
24
1.92
16211509--16211678
93
1.8
93
96
0
313
28
29
21
21
1.98
16211500--16211675
46
3.8
46
79
14
209
28
29
20
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345