Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
18
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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4.8
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129
25
25
20
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3322277--3322412
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24
20
30
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1
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1
31.0
1
93
0
53
0
0
3
96
0.21
3341321--3341357
16
2.4
16
86
8
51
29
0
0
70
0.88
3341523--3341561
15
2.8
14
81
11
53
38
12
2
46
1.56
3342151--3342206
22
2.5
22
94
0
103
26
33
25
14
1.94
3343779--3343805
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
3344465--3344526
22
3.1
21
75
13
60
8
14
4
72
1.24
3345250--3345286
16
2.2
16
90
4
56
54
8
0
37
1.30
3345495--3345539
3
15.0
3
100
0
90
66
0
0
33
0.92
3346529--3346574
15
2.9
15
90
6
65
26
6
0
67
1.15
3346454--3346564
17
6.4
18
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22
67
27
6
0
65
1.22
3346549--3346587
21
1.9
21
89
5
62
28
5
0
66
1.12
3346544--3346593
21
2.5
20
78
12
57
32
4
0
64
1.12
3346440--3346620
86
2.1
86
79
11
192
28
6
1
64
1.25
3346712--3346773
25
2.5
24
75
17
63
32
9
1
56
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3348406--3348462
26
2.1
27
81
9
64
57
3
3
35
1.33
3349956--3349992
2
19.0
2
94
5
67
48
0
0
51
1.00
3356839--3356878
19
2.1
19
86
9
55
55
0
2
42
1.13
3359474--3359742
103
2.6
103
97
0
511
22
17
14
44
1.85
3362174--3362233
31
2.0
31
90
3
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50
1
3
45
1.28
3365307--3365336
12
2.5
12
94
0
51
10
50
23
16
1.75
3369391--3369448
28
2.1
28
100
0
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32
6
17
43
1.75
3376711--3376758
21
2.2
21
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10
53
41
0
8
50
1.33
3377317--3377400
32
2.5
33
79
9
91
64
3
2
29
1.23
3377483--3377550
31
2.2
32
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2
102
27
7
19
45
1.76
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21
2.0
21
90
0
64
24
19
29
26
1.98
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13
2.2
13
100
0
56
21
21
25
32
1.98
3386740--3386801
21
3.0
21
95
0
106
25
29
20
24
1.99
3389393--3389475
15
5.1
17
69
26
56
46
14
0
38
1.45
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50
2.0
50
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182
46
14
0
39
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3389389--3389464
15
4.8
16
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19
61
48
13
0
38
1.42
3389378--3389487
50
2.2
50
91
3
177
47
12
0
39
1.48
3398629--3398682
23
2.7
20
77
16
58
51
0
1
46
1.11
3398885--3398932
19
2.6
19
86
3
62
70
0
4
25
1.04
3452137--3452177
22
2.0
22
85
9
59
48
4
4
41
1.46
3453715--3453744
10
2.8
11
90
10
53
50
0
0
50
1.00
3456080--3456126
21
2.2
21
85
7
60
53
0
2
44
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3459792--3459851
29
2.0
30
84
15
81
56
6
11
25
1.59
3466724--3466768
23
2.0
23
90
0
72
31
2
0
66
1.04
3466732--3466786
29
2.0
27
85
7
74
30
1
0
67
1.01
3466784--3466868
39
2.2
40
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2
109
24
1
8
65
1.27
3468299--3468358
21
2.7
22
76
18
70
60
3
1
35
1.23
3468402--3468460
30
2.0
30
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0
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11
0
28
1.33
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0
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2
100
0
52
50
0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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