Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  74  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20283361--20283394
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0
0
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103
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1.9
25
82
0
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29
10
29
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
0
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0
0
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3
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11
23
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23
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22
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22
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0
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28
0
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2.0
44
88
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15
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53
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25
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2.0
26
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21
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0
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18
79
15
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32
0
9
58
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
71
1.18
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3.9
27
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110
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8
31
1.47
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2.0
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1.40
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479
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23
20
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20
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177
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21
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0
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2.1
25
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1
5
35
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1.40
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12
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1.48
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4
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1.40
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13.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20375887--20376056
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25
24
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1.99
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40
5.2
40
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2
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25
24
28
21
1.99
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11
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23
10
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31
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1.89
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95
0
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24
20
34
21
1.97
20394246--20394455
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
20402384--20402593
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
20408020--20408237
40
5.5
40
85
4
266
23
22
28
25
1.99
20414619--20414771
39
3.9
39
91
0
243
23
20
32
24
1.98
20414620--20414801
39
4.6
39
88
0
238
23
21
31
23
1.98
20423513--20423682
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
20431610--20431819
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
20433585--20433716
35
3.6
37
82
12
157
32
23
11
32
1.90
20438405--20438474
33
2.2
32
84
7
88
41
5
4
48
1.46
20439102--20439130
15
1.9
15
100
0
58
75
0
0
24
0.80
20452501--20452558
30
2.1
28
81
15
68
25
39
1
32
1.66
20453119--20453156
19
2.0
20
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36
5
21
36
1.76
20454413--20454443
9
3.4
9
90
0
53
25
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25
2.1
24
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3
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43
21
15
19
1.88
20459776--20459821
18
2.6
18
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0
83
19
4
17
58
1.55
20461806--20461844
14
2.8
14
92
0
60
38
17
2
41
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20465661--20465721
30
2.1
29
93
3
104
34
22
18
24
1.96
20469192--20469322
33
4.0
33
87
2
174
41
16
23
19
1.90
20470281--20470314
14
2.4
14
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0
50
23
5
5
64
1.38
20473119--20473153
18
1.9
18
100
0
70
34
5
11
48
1.63
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57
2.1
58
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27
17
5
49
1.68
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2
17.0
2
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6
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0
0
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1.00
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21
27
28
1.99
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1.8
93
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28
27
1.99
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15
56
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7
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21
21
28
28
1.98
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1.9
91
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1.99
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29
2.2
29
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5
105
9
16
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21
21
28
28
1.98
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1.8
93
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0
315
21
21
29
28
1.98
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40
5.2
40
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21
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40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
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1.8
93
96
0
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27
29
21
20
1.98
20510980--20511155
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3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
20518531--20518702
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
20518524--20518699
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3.8
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216
28
29
21
20
1.98
20520727--20520751
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20525378--20525425
25
1.9
25
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0
69
33
27
16
22
1.96
20525473--20525528
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
20525462--20525528
20
3.3
20
93
0
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34
11
20
32
1.90
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47
2.1
47
92
2
158
28
22
20
28
1.99
20525578--20525681
23
4.4
24
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3
158
28
22
22
26
1.99
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2.1
31
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0
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23
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36
0
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1.58
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2.3
13
100
0
60
20
6
0
73
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345