Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  62  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17214301--17214357
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2.2
27
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1
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17214301--17214358
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2.2
27
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1
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1.22
17214311--17214371
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1.21
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0
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2.0
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100
0
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15
38
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37
22
23
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77
0.90
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51
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112
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26
20
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25
91
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2
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11.3
3
87
6
50
60
0
3
36
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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2.2
22
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25
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26
25
19
29
1.98
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1.9
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90
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14
22
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1.94
17268065--17268162
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16
20
30
1.94
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1.9
76
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14
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78
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1.9
13
100
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45
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28
18
23
1.98
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4.9
48
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283
28
24
18
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1.98
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100
2.3
98
84
3
274
29
24
18
27
1.98
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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4.3
43
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23
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26
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0
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0
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85
11
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21
5
1
70
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17387097--17387166
25
2.9
24
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17
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21
5
1
71
1.15
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0
0
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0
0
58
0.98
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13
2.0
13
100
0
52
84
0
15
0
0.62
17405671--17405708
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
17407554--17407781
46
5.0
46
89
1
305
38
15
25
21
1.92
17417762--17417824
29
2.2
29
100
0
126
30
0
20
49
1.49
17419139--17419196
21
2.8
21
97
0
107
15
31
34
18
1.93
17419140--17419216
21
3.6
21
89
5
84
16
31
33
18
1.93
17423647--17423680
17
2.0
17
88
0
50
29
0
8
61
1.26
17424080--17424110
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
17425243--17425283
18
2.3
18
87
8
57
48
0
21
29
1.50
17425771--17425808
20
1.9
20
84
10
51
47
0
10
42
1.38
17426929--17426957
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
17427997--17428119
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38
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0
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19
22
26
30
1.98
17428112--17428225
46
2.6
44
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8
126
23
22
27
26
2.00
17435805--17435853
19
2.6
19
77
22
50
8
30
2
59
1.38
17436553--17436746
96
2.0
96
97
0
370
42
6
15
35
1.73
17449881--17449914
17
2.0
17
100
0
68
35
23
11
29
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17450289--17450348
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21
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0
84
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23
11
23
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17450502--17450561
21
2.9
21
89
0
84
41
23
11
23
1.87
17450213--17450638
213
2.0
213
99
0
843
35
17
13
32
1.90
17459746--17459831
21
4.1
21
86
0
100
16
22
25
36
1.94
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3
28.7
3
80
11
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63
3
1
32
1.19
17463508--17463546
20
2.0
20
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5
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51
2
5
41
1.38
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26
6.2
26
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0
248
34
6
22
36
1.81
17464400--17464559
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3.1
52
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0
275
34
6
22
36
1.81
17474468--17474575
44
2.4
44
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30
23
12
33
1.92
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2
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2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
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22
2.0
22
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4
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60
6
2
30
1.35
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22
2.0
25
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12
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39
6
6
47
1.55
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3
14.0
3
100
0
84
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0
0
66
0.92
17482749--17482789
21
2.0
21
85
0
55
51
0
12
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1.40
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0
0
18
0.70
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3.3
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80
0
0
19
0.71
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22
2.0
22
100
0
90
8
8
31
51
1.64
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5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
17487995--17488025
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
17488484--17488517
17
2.0
17
94
0
59
50
0
0
50
1.00
17498056--17498090
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2.1
17
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5
54
54
0
0
45
0.99
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23
1.9
22
86
13
61
72
6
4
16
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17508204--17508330
45
2.9
45
85
8
147
23
28
23
24
2.00
17508678--17508957
38
7.3
38
85
3
371
29
25
22
22
1.99
17508718--17508957
78
3.1
78
92
1
385
29
24
23
22
1.99
17508677--17508957
116
2.4
116
86
2
386
29
24
23
22
1.99
17508678--17508957
78
3.6
78
88
1
379
29
25
22
22
1.99
17516837--17516903
17
3.6
18
80
11
64
64
1
2
31
1.18
17516842--17516906
9
6.7
10
72
18
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64
0
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2.1
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1.15
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0
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0
0
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1.00
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2.1
18
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5
56
61
0
0
38
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345