Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1210339--1210381
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2.0
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0
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13
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3
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1.20
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3.1
19
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0
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1.10
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36
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0
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
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0
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0
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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22
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90
0
10
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1344455--1344517
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23
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14
56
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1364704--1364758
28
1.9
28
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1
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58
57
2
2
36
1.26
1395921--1396031
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
1402138--1402183
20
2.3
20
85
10
60
30
6
17
45
1.73
1402629--1402665
19
1.9
19
88
0
56
45
0
5
48
1.25
1402700--1402736
16
2.3
16
86
13
58
40
0
0
59
0.97
1402747--1402802
22
2.6
22
83
5
62
51
1
0
46
1.11
1406922--1407023
53
1.9
52
92
2
168
39
12
9
38
1.77
1408661--1408689
9
3.3
9
95
4
51
0
6
0
93
0.36
1408659--1408688
14
2.1
15
93
6
53
0
10
0
90
0.47
1421874--1421940
30
2.3
29
83
14
93
58
5
1
34
1.32
1425900--1425940
20
2.0
22
85
9
59
12
7
21
58
1.58
1427173--1427218
24
2.0
24
82
4
58
43
21
0
34
1.53
1438789--1438813
13
1.9
13
100
0
50
40
16
8
36
1.77
1441866--1441921
16
3.4
17
79
16
64
66
3
0
30
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1443831--1443873
23
1.9
22
86
13
61
44
0
2
53
1.13
1448976--1449194
72
3.1
72
87
1
350
21
23
25
30
1.99
1449163--1449208
24
1.9
24
90
0
74
26
34
10
28
1.90
1450195--1450258
6
10.7
6
91
0
74
3
56
17
23
1.55
1450195--1450258
18
3.6
18
91
0
92
3
56
17
23
1.55
1451393--1451431
19
2.0
20
85
5
53
35
0
2
61
1.10
1452112--1452147
18
2.0
18
89
10
56
50
0
11
38
1.38
1452192--1452229
11
3.1
12
85
14
51
42
0
0
57
0.98
1452235--1452275
18
2.3
18
86
0
55
73
7
12
7
1.25
1452997--1453048
27
1.9
27
84
7
70
36
0
25
38
1.56
1464099--1464123
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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10
2.5
10
100
0
50
16
0
0
84
0.63
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3
10.0
3
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0
51
30
3
33
33
1.74
1474685--1474716
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
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12
100
0
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0
7
0
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0.39
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12
2.5
12
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0
51
16
0
13
70
1.18
1486671--1486702
16
2.1
16
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5
57
81
0
18
0
0.70
1489911--1489948
16
2.5
15
91
8
67
63
0
0
36
0.95
1493008--1493077
33
2.2
33
84
7
90
28
1
11
58
1.41
1494091--1494123
16
2.0
17
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5
50
39
0
0
60
0.97
1497569--1497619
16
3.4
15
78
7
59
49
0
3
47
1.20
1506634--1506670
3
12.3
3
94
0
65
35
35
29
0
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1508424--1508448
2
12.5
2
100
0
50
52
0
48
0
1.00
1512531--1512569
13
3.0
13
84
0
51
58
17
0
23
1.38
1516436--1516463
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
1518578--1518604
14
1.9
14
100
0
54
40
7
7
44
1.60
1519453--1519521
29
2.3
30
80
2
77
43
4
1
50
1.30
1526001--1526053
16
3.1
17
78
13
63
30
3
0
66
1.10
1530390--1530478
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2.0
45
90
0
142
23
19
21
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2.0
40
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1
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2.0
22
90
0
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9
9
0
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0.87
1535347--1535474
35
3.5
35
88
5
166
31
9
25
33
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345