Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  345  ( 41379 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2.2
22
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26
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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8701066--8701118
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1.9
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70
26
26
18
28
1.98
8701147--8701192
20
2.3
20
82
14
60
28
28
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2.5
20
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62
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0
2
56
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.3
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19
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1.24
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1.9
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103
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1.28
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2.0
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0
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4
152
34
13
24
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3.0
12
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17
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1.9
316
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15
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17
21
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1.96
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3.1
34
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135
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12
3
4
1.04
8772940--8772993
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28
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1
0
42
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
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18
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1
7
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19
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20
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43
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0
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16
40
1.84
8796512--8796551
20
2.1
19
85
4
53
52
7
7
32
1.58
8799407--8799466
24
2.5
24
71
15
61
58
8
5
28
1.48
8800808--8800868
29
2.1
30
93
3
106
40
29
9
19
1.84
8800964--8800998
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
8801020--8801210
77
2.5
76
87
3
265
32
18
16
31
1.94
8801018--8801454
75
5.5
78
76
13
288
32
19
17
31
1.94
8800640--8801478
253
3.4
244
80
8
740
35
18
16
29
1.93
8801227--8801582
80
4.7
75
85
6
416
32
19
16
31
1.94
8801227--8801582
155
2.4
147
84
6
437
32
19
16
31
1.94
8801536--8801631
49
2.0
49
93
0
165
34
20
14
30
1.93
8801464--8801703
121
2.0
121
91
0
390
35
17
15
31
1.92
8801585--8801803
72
2.9
76
84
6
277
31
19
16
31
1.94
8801826--8802020
72
2.7
71
85
4
257
34
24
15
25
1.94
8801278--8801992
278
2.6
274
79
7
816
32
20
16
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8801631--8802194
199
2.8
195
84
5
677
33
21
16
28
1.95
8801895--8802140
122
2.0
123
85
5
338
36
23
15
23
1.93
8802020--8802194
70
2.5
70
83
4
203
32
24
14
28
1.95
8803064--8803095
7
4.7
7
96
3
57
0
9
0
90
0.45
8810391--8810421
12
2.6
12
94
0
53
45
6
22
25
1.76
8814339--8814390
15
3.5
15
70
19
54
11
32
30
25
1.91
8814329--8814397
30
2.3
30
100
0
138
15
33
28
21
1.95
8815847--8815891
19
2.4
19
85
7
56
62
2
4
31
1.27
8816878--8816906
13
2.1
14
93
6
51
44
3
0
51
1.18
8817561--8817591
10
3.2
10
95
4
55
80
0
9
9
0.90
8818976--8819070
21
4.7
21
85
3
124
43
20
23
13
1.87
8819007--8819106
42
2.4
42
84
3
121
48
14
23
15
1.80
8820719--8820747
12
2.5
12
94
5
51
27
6
6
58
1.50
8820833--8820870
20
1.9
20
94
0
67
21
0
5
73
1.02
8820836--8820878
20
2.2
20
83
4
52
23
2
6
67
1.27
8820852--8820897
25
1.9
23
86
8
65
30
2
6
60
1.34
8825914--8825957
20
2.1
21
84
12
56
43
9
4
43
1.56
8832504--8832560
15
3.7
15
80
2
60
61
1
8
28
1.36
8832860--8832939
26
3.0
26
71
10
79
62
8
1
27
1.32
8832993--8833031
2
20.0
2
94
5
71
48
0
0
51
1.00
8835476--8835510
18
1.9
18
100
0
70
40
0
0
60
0.97
8836270--8836300
2
15.5
2
100
0
62
51
0
48
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8838392--8838448
25
2.3
23
80
14
62
63
14
5
17
1.48
8838673--8838817
3
48.3
3
72
11
57
57
2
9
30
1.42
8838776--8838817
19
2.3
18
87
4
57
69
2
2
26
1.13
8839181--8839236
22
2.5
22
85
5
78
17
0
46
35
1.49
8839181--8839249
13
5.9
13
71
23
64
15
0
47
36
1.46
8839332--8839376
15
2.9
15
86
3
54
6
4
37
51
1.49
8839747--8840213
206
2.3
207
95
0
839
27
23
19
29
1.98
8843219--8843552
46
7.9
39
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14
341
35
15
24
24
1.94
8843258--8843642
46
8.7
46
83
10
473
37
14
24
23
1.92
8843209--8843598
84
4.5
84
91
3
575
36
15
23
24
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345