Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  93  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25376182--25376243
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2.0
22
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2.7
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20
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1.83
25421047--25421205
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2.0
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200
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136
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4.1
9
92
0
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29
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
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24
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20
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2.7
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33
21
24
19
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2.6
53
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237
33
23
24
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3
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26
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26
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2.4
33
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0
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16
46
10
27
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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0
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2.9
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110
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7
10
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1.65
25488248--25488313
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7
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48
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30
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11
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26
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2
173
36
23
7
33
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25526590--25526749
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80
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311
33
19
17
30
1.95
25529613--25529664
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2.1
25
92
0
86
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0
13
42
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10
46
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44
2.5
44
86
3
148
30
14
27
28
1.95
25572121--25572619
205
2.5
200
89
2
741
31
17
20
29
1.96
25574240--25574290
23
2.3
23
86
10
70
37
0
3
58
1.16
25574256--25574356
37
2.8
36
77
14
102
32
4
0
62
1.17
25574595--25574619
8
3.1
8
100
0
50
48
0
0
52
1.00
25574663--25574726
18
3.5
19
70
18
55
29
1
6
62
1.29
25581750--25581790
19
2.3
18
91
8
66
56
0
4
39
1.21
25581929--25581970
21
2.0
21
100
0
84
42
9
14
33
1.78
25584843--25584883
21
2.0
21
90
0
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29
21
29
19
1.98
25588680--25588740
6
10.2
6
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0
95
50
0
31
18
1.47
25590453--25590481
13
2.1
14
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51
13
13
0
72
1.13
25593838--25594120
43
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43
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0
494
31
33
24
10
1.90
25594113--25594255
38
3.7
38
84
1
133
28
27
20
23
1.99
25594162--25594276
40
2.9
40
92
2
189
25
26
24
23
2.00
25595233--25595258
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
25598582--25598671
42
2.1
43
87
6
130
47
14
6
31
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25601854--25601948
41
2.3
41
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1
120
35
21
21
22
1.96
25601874--25601951
41
1.9
41
94
0
138
35
21
20
21
1.96
25601942--25602045
41
2.5
41
92
0
172
24
18
30
26
1.98
25602708--25602782
35
2.1
35
82
4
89
17
0
25
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1.40
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2.8
14
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0
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15
0
28
56
1.40
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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1.9
18
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2
2
44
1.32
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.0
24
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1.63
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2.2
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2
114
29
15
26
29
1.96
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39
6.5
39
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2
345
30
27
21
19
1.98
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77
3.3
78
88
3
365
30
27
21
20
1.98
25614767--25615012
116
2.1
117
86
3
343
30
28
21
19
1.98
25621961--25622279
135
2.3
136
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5
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7
15
45
1.74
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2.2
26
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12
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1.80
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0
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0
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0
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2.0
15
100
0
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0
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40
1.43
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2.8
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41
0
3
54
1.18
25640515--25640588
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3.2
23
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0
85
41
1
6
50
1.37
25644786--25644938
39
3.9
39
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0
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30
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24
1.99
25644755--25644937
78
2.3
79
89
1
269
22
29
22
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25646966--25647008
19
2.3
19
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8
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76
2
2
18
1.00
25647226--25647272
20
2.2
20
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31
0
34
34
1.58
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.1
29
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0
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20
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100
0
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0
0
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0
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2.1
27
100
0
114
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0
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130
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18
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84
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7
0
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17
2.1
17
89
5
54
57
0
8
34
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345