Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  82  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22515788--22515962
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0
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2.4
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24
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15
0
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20
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6.3
87
80
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21
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22552298--22552849
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14
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33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.9
39
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24
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1.36
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60
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13
15
41
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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17
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1.93
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24
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21
22
25
29
1.99
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243
22
23
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15
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36
3
0
60
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
2
25
72
0.96
22692610--22692658
23
2.3
22
80
13
57
26
6
4
63
1.36
22694304--22694406
33
3.2
33
84
4
140
33
0
3
62
1.14
22694304--22694406
3
34.3
3
78
7
111
33
0
3
62
1.14
22694862--22694900
12
3.5
12
86
13
57
61
7
5
25
1.44
22699678--22699927
48
5.2
48
92
0
410
36
5
26
32
1.80
22700060--22700280
37
6.0
37
95
0
379
23
19
31
26
1.98
22704996--22705241
118
2.1
117
93
2
422
39
8
10
41
1.72
22705238--22705282
19
2.4
19
92
3
74
31
11
8
48
1.69
22712149--22712192
17
2.9
15
83
12
54
22
0
0
77
0.77
22712141--22712191
27
1.9
27
84
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23
0
1
74
0.92
22714174--22714221
19
2.6
19
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35
2
14
47
1.56
22714235--22714327
43
2.2
43
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3
152
27
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13
51
1.66
22718899--22718946
19
2.6
19
80
9
55
35
2
14
47
1.56
22718960--22719052
43
2.2
43
88
3
134
27
5
12
53
1.60
22720057--22720181
43
2.6
47
80
16
143
47
14
3
35
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22720082--22720187
56
1.9
56
94
3
187
47
15
3
33
1.63
22720663--22720699
11
3.2
12
88
11
60
81
0
0
18
0.70
22721793--22721920
64
2.0
64
89
0
193
31
16
13
39
1.87
22722315--22722591
82
3.1
91
78
13
326
25
23
22
28
1.99
22722725--22723065
176
1.9
175
83
2
443
29
16
24
28
1.97
22734550--22734599
18
2.9
18
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5
59
54
4
0
42
1.19
22737291--22737333
18
2.5
17
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34
0
2
62
1.08
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2
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2
93
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0
3
48
1.17
22741730--22741762
17
2.0
17
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5
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48
9
0
42
1.35
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2.8
28
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11
81
17
0
26
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1.42
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7
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7
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12
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19
0
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1.50
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28
2.0
29
92
3
96
19
0
35
44
1.51
22750974--22751005
15
2.0
17
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11
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56
6
3
34
1.40
22751036--22751253
45
4.5
46
72
18
167
48
16
1
34
1.55
22751087--22751255
9
19.0
9
72
10
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17
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1.55
22751086--22751208
36
3.7
36
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18
147
47
17
0
34
1.54
22751087--22751215
63
2.1
63
91
2
208
48
17
0
33
1.53
22751042--22751252
27
7.9
26
69
14
101
48
16
1
33
1.55
22751150--22751253
43
2.4
44
85
8
140
48
16
1
33
1.57
22752898--22752931
16
2.1
15
89
10
50
70
5
2
20
1.21
22753420--22753570
8
20.1
7
71
19
67
65
0
1
32
1.06
22753407--22753495
40
2.2
42
82
11
105
64
1
1
33
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22753437--22753571
29
4.8
28
77
16
120
65
0
1
32
1.07
22753407--22753570
55
3.1
54
81
11
180
64
1
1
32
1.09
22753434--22753571
12
11.5
12
71
17
83
65
0
1
32
1.07
22753407--22753571
57
3.0
56
80
11
191
64
1
1
33
1.09
22753559--22753596
19
2.0
20
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42
0
2
55
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29
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0
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0
0
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17
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0
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9
0
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2
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29
1.26
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2.0
40
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5
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30
32
12
24
1.93
22760378--22760464
44
2.0
44
90
4
140
33
26
21
18
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345