Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6685225--6685257
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0
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12
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0
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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6788794--6788858
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2.5
24
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20
1
4
72
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
0
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0
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2.1
15
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53
56
0
10
33
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6828728--6828762
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16
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54
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0
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2
1
45
1.22
6857506--6857568
22
2.8
22
78
4
63
58
1
0
39
1.07
6860096--6860145
25
2.0
25
100
0
100
4
24
4
68
1.24
6860099--6860154
25
2.2
25
87
6
78
3
28
3
64
1.27
6861409--6861500
21
4.4
21
95
0
166
4
44
18
32
1.69
6866724--6866748
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
6867149--6867182
18
1.9
17
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5
50
41
2
14
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1.61
6878409--6878434
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12
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0
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0
46
1.53
6881697--6881910
108
2.0
108
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2
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0
0
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1.00
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2.1
17
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0
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0
0
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23
1.9
23
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9
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22
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15
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1.65
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2.0
30
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10
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4
6.2
4
100
0
50
28
0
48
24
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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0
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0
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0
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4
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1.70
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2.0
104
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16
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0
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0
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2.0
27
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0
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11
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2.5
24
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5
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0
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0
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0
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0
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0
0
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0
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0
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0
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35
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25
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20
2.5
20
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20
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1.82
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20
2.0
20
100
0
78
20
41
25
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24
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3
6
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30
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15
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30
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0
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1.23
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15
2.9
15
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28
6
0
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1.17
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29
7
0
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1.30
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29
8
0
61
1.30
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25
2.3
25
78
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62
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7
1
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1.37
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2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6951107--6951142
2
18.5
2
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50
0
0
50
1.00
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12
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65
0
0
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7
53
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0
0
34
0.93
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3.1
32
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0
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18
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1
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1.30
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0
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2.0
31
93
0
108
36
0
7
55
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345