Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  22  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6.6
72
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368
33
19
16
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1.93
7362218--7362413
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2.6
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229
30
19
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1.94
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3.0
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Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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21
18
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
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Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
7492094--7492124
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28
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51
0
29
19
1.47
7519550--7519614
32
2.0
32
96
0
121
47
13
9
29
1.74
7519559--7519611
16
3.3
16
69
10
54
45
9
11
33
1.72
7521830--7521882
22
2.3
23
93
6
90
69
9
9
11
1.36
7522231--7522263
11
3.0
11
91
8
50
33
0
12
54
1.37
7522603--7522635
17
1.9
17
93
0
57
72
3
9
15
1.21
7522664--7523423
138
5.5
138
92
1
1229
57
7
7
27
1.54
7526085--7526123
17
2.3
17
91
8
62
46
10
10
33
1.72
7531130--7531194
35
1.9
33
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12
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29
0
7
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1.22
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21
2.3
20
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7
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20
0
8
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1.12
7531194--7531241
26
1.9
24
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8
69
29
0
6
64
1.18
7531503--7531551
21
2.3
22
86
10
75
0
26
0
73
0.83
7531878--7531919
21
2.0
21
95
0
75
23
21
16
38
1.93
7533923--7533955
11
3.0
11
95
0
57
30
33
27
9
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7539153--7539194
21
2.0
22
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4
59
42
4
16
35
1.69
7546462--7546495
16
2.1
16
100
0
68
44
5
0
50
1.26
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9
5.9
9
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27
52
51
0
0
48
1.00
7547601--7547649
17
3.1
17
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22
70
53
0
0
46
1.00
7549986--7550211
46
5.1
46
79
11
215
22
23
16
38
1.93
7550141--7550224
21
4.2
21
75
14
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26
25
13
35
1.92
7550130--7550211
37
2.2
37
97
0
155
24
24
17
34
1.96
7552415--7552452
11
3.5
11
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3
60
71
0
2
26
1.00
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20
2.5
20
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10
55
56
4
0
39
1.19
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2.2
27
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6
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33
0
0
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0.92
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3
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3
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8
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0
31
0
68
0.90
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2.4
27
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0
119
12
34
35
17
1.87
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25
2.6
25
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14
78
65
0
0
34
0.93
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16
1.9
16
93
0
53
67
0
29
3
1.06
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92
1.8
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257
33
0
15
50
1.44
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114
3.9
113
92
4
721
30
1
16
51
1.51
7562432--7562880
229
2.0
228
91
4
735
30
1
16
51
1.51
7562929--7562960
15
2.1
16
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5
57
37
0
6
56
1.25
7565141--7565267
42
3.0
42
84
6
161
29
25
14
30
1.95
7565226--7565347
47
2.6
46
86
1
163
29
27
15
27
1.96
7565374--7565521
31
4.8
31
89
4
219
25
27
20
27
1.99
7565497--7565625
50
2.5
51
90
5
199
25
22
16
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7565741--7565769
14
2.0
15
93
6
51
55
17
6
20
1.65
7569242--7569304
27
2.3
27
80
0
72
26
22
26
23
2.00
7574480--7574524
23
2.0
23
82
4
56
42
2
11
44
1.52
7574839--7574886
17
3.1
17
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27
52
27
4
8
60
1.44
7574826--7574886
29
2.1
29
96
0
113
29
4
6
59
1.44
7575610--7575640
12
2.7
11
90
9
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0
0
70
0.87
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17
2.0
17
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0
0
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20
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0
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1.02
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5
7.4
5
93
0
65
0
37
18
43
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345