Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  54  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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109
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38
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
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Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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30
1.96
15380885--15380933
21
2.3
21
85
0
71
18
0
30
51
1.47
15380918--15380968
21
2.4
21
90
0
75
19
1
41
37
1.63
15381902--15382219
115
2.8
113
84
4
377
25
17
23
33
1.97
15383006--15383030
12
2.1
12
100
0
50
68
0
0
32
0.90
15385537--15385812
42
6.5
43
83
5
321
25
15
27
31
1.96
15385538--15385812
85
3.2
86
85
3
369
25
16
27
30
1.96
15387299--15387335
18
2.1
18
94
0
65
40
16
18
24
1.90
15391137--15391173
19
1.9
19
94
0
65
13
13
13
59
1.62
15393651--15393737
41
2.1
41
85
2
113
31
21
24
22
1.99
15393673--15393780
41
2.6
41
89
1
153
30
23
22
24
1.99
15393673--15393795
41
3.0
39
82
5
138
31
23
22
21
1.98
15393768--15393909
42
3.6
41
82
12
206
25
21
26
26
1.99
15393830--15393899
35
2.0
35
97
0
131
18
22
27
31
1.97
15393919--15393958
20
2.0
20
85
9
55
30
7
7
55
1.56
15394103--15394210
7
15.1
7
71
7
65
21
0
37
39
1.60
15394390--15394427
14
2.7
15
84
12
53
18
0
36
44
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15394395--15394508
7
16.1
7
68
8
61
22
0
39
37
1.55
15395316--15395356
16
2.5
16
81
18
57
43
4
2
48
1.37
15397514--15397685
93
1.8
93
82
4
222
36
21
23
18
1.95
15403102--15403214
60
1.9
60
85
7
158
37
15
28
19
1.92
15407270--15407340
37
1.9
37
83
11
92
71
5
4
18
1.22
15407299--15407340
20
2.1
20
91
8
68
73
4
2
19
1.12
15407385--15407426
20
2.0
20
86
4
57
61
7
7
23
1.47
15410125--15410177
27
2.0
27
84
0
70
28
16
37
16
1.91
15412953--15412977
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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15
2.4
15
100
0
72
33
0
58
8
1.28
15422755--15422794
18
2.3
18
87
8
57
17
2
0
80
0.83
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22
2.4
22
83
9
61
13
3
1
80
0.94
15435048--15435135
44
2.0
42
85
8
115
37
9
3
50
1.51
15435274--15435299
4
6.5
4
100
0
52
50
0
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26
1.50
15436139--15436196
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19.3
3
100
0
116
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0
0
32
0.91
15438926--15438954
11
2.7
11
94
5
51
17
0
0
82
0.66
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35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
15440729--15440900
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
15448228--15448394
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
15448223--15448394
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
15450309--15450399
45
2.0
45
100
0
182
41
10
15
31
1.82
15451469--15451522
20
2.7
19
72
8
54
33
0
1
64
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15456140--15456173
5
6.6
5
93
6
59
17
0
0
82
0.67
15460133--15460193
30
2.0
30
100
0
122
26
22
16
34
1.95
15465354--15465556
100
2.0
100
94
0
352
30
14
19
35
1.91
15473124--15473703
172
3.4
172
79
7
522
28
23
18
29
1.98
15473136--15473709
168
3.4
168
78
9
430
29
22
18
29
1.97
15482742--15482800
17
3.2
17
77
15
64
76
1
1
20
0.96
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2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
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288
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14
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1.9
21
89
0
62
32
12
15
40
1.84
15511356--15511504
43
3.6
41
85
6
185
30
28
18
22
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345