Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  144  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39292667--39292722
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1.98
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0
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10
30
1.86
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1.99
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30
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1
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22
23
15
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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2.5
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1.99
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21
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1.99
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5.2
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2
305
25
24
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.91
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11
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1.91
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Indices
Period
Size
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A
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(0-2)
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2.00
39496976--39497163
80
2.3
80
79
12
206
26
23
27
22
2.00
39504856--39504966
54
2.0
55
81
10
129
27
9
16
47
1.76
39504989--39505047
30
2.0
30
89
0
91
27
8
5
59
1.48
39504995--39505059
30
2.2
30
86
5
87
26
7
6
60
1.48
39505162--39505235
13
5.7
13
77
14
73
21
2
18
56
1.54
39505162--39505235
37
2.0
37
84
5
96
21
2
18
56
1.54
39505218--39505426
79
2.7
79
85
3
262
25
5
19
49
1.69
39505301--39505391
33
2.7
33
77
1
101
26
5
17
50
1.68
39505380--39505463
9
8.6
9
71
17
51
26
1
17
54
1.50
39505324--39505429
46
2.3
47
85
8
137
26
4
17
50
1.66
39505422--39505482
16
4.0
16
83
12
83
27
0
19
52
1.46
39505377--39505467
29
3.0
29
85
7
112
27
1
17
53
1.51
39505411--39505480
29
2.4
29
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2
104
28
0
20
51
1.47
39516318--39516481
40
4.1
40
86
3
204
23
21
28
26
1.99
39516318--39516481
80
2.0
80
90
2
258
23
21
28
26
1.99
39517942--39518001
25
2.4
26
83
8
88
28
28
20
23
1.99
39517942--39518038
25
3.9
25
78
4
79
29
22
23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39520433--39520608
46
3.8
45
79
11
196
22
20
28
28
1.98
39520429--39520600
93
1.8
93
92
2
292
22
20
29
27
1.99
39524562--39524736
48
3.6
48
78
0
197
27
28
17
27
1.97
39529133--39529263
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
39529133--39529263
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
39536961--39537091
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
39536961--39537091
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
39538559--39538593
18
2.0
18
88
5
54
28
14
20
37
1.91
39539637--39539743
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1.9
56
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130
24
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14
27
1.95
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19
2.5
19
86
3
60
19
36
17
27
1.93
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29
2.6
28
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20
80
27
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12
26
1.92
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16
2.2
16
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5
52
8
20
20
50
1.75
39547681--39547723
15
2.8
15
85
3
59
6
18
23
51
1.70
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46
3.6
46
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136
25
16
14
43
1.86
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44
4.6
44
75
12
127
24
16
13
44
1.84
39553321--39553345
12
2.1
12
100
0
50
40
8
8
44
1.63
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16
2.1
16
100
0
68
61
11
0
26
1.30
39557251--39557304
27
2.0
27
96
0
99
25
24
7
42
1.80
39566290--39566327
12
3.2
12
100
0
76
68
0
15
15
1.22
39567294--39567326
14
2.4
14
95
5
59
27
0
0
72
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16
4.2
16
75
1
55
48
4
7
39
1.51
39570319--39570396
9
7.4
10
72
21
52
30
3
2
62
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39570509--39570540
16
2.0
16
100
0
64
31
18
0
50
1.48
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12
3.7
12
75
18
52
51
19
19
9
1.74
39578036--39578088
21
2.5
21
100
0
106
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20
7
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16
2.7
15
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7
55
43
0
0
56
0.99
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3.9
7
100
0
54
55
0
0
44
0.99
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16
2.0
17
94
5
59
51
18
6
24
1.68
39599881--39600055
46
3.8
46
76
13
196
29
29
20
21
1.98
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1.8
93
94
0
308
28
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1.98
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2.0
17
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54
18
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21
1.64
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29
2.1
29
96
0
115
33
0
38
27
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345