Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10901248--10901298
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1.20
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18
3.1
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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270
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22
20
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36
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5.4
125
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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10
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1.90
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131
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56
41
0
5
52
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11013586--11013667
33
2.6
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53
4
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20
2.0
20
90
0
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43
24
12
19
1.85
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22
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11
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1.22
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5
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0
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9
19
1.69
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33
2.2
33
86
5
97
8
50
26
14
1.71
11035626--11035650
5
5.0
5
100
0
50
20
0
20
60
1.37
11037389--11037413
7
3.6
7
100
0
50
88
0
12
0
0.53
11039882--11039907
8
3.2
8
100
0
52
11
0
0
88
0.52
11043890--11043917
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
11044698--11044731
18
1.9
17
88
5
50
55
5
0
38
1.24
11044960--11045099
74
1.9
73
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10
160
46
5
16
31
1.70
11047538--11047591
19
2.9
18
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17
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74
7
3
14
1.18
11047691--11047723
3
11.0
3
100
0
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33
0
33
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33
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0
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16
8
30
1.75
11049295--11049329
18
1.9
18
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20
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24
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1.86
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6
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0
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0
1.42
11050516--11050564
12
4.1
12
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0
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2
1.58
11058775--11058841
32
2.1
32
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0
134
16
8
14
59
1.59
11058780--11058864
32
2.7
32
87
3
93
14
9
14
62
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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24
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0
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0
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23
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2.0
108
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0
427
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18
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7
4.3
7
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0
0
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2.0
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0
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0
0
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13
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0
50
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0
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1.29
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210
27
18
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22
1.98
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2.4
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19
30
1.92
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21
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1.95
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1.95
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1.8
212
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2.0
129
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0
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1.64
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2
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2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
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2.0
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39
2.3
39
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0
126
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24
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1.96
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3.3
54
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0
210
26
23
27
22
2.00
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54
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0
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22
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22
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12
100
0
50
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8
0
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2.5
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189
35
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17
24
1.95
11101872--11101934
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3.0
21
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60
1.37
11105023--11105240
49
4.6
47
76
5
154
24
27
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11105023--11105386
47
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49
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256
22
28
20
28
1.99
11105021--11105384
141
2.6
139
80
7
360
22
28
20
28
1.99
11105021--11105390
94
3.9
94
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7
367
22
28
20
28
1.99
11107909--11107961
24
2.2
25
83
16
76
45
0
26
28
1.54
11111823--11111860
15
2.4
16
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28
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1.49
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29
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1
0
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0
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0
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0
0
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6.0
55
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9
227
22
17
5
55
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345