Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  11  of  345  ( 41379 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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233
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27
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2.8
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27
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43
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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G
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Entropy
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25
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64
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2.0
38
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0
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2
6
26
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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5
3
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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5
62
55
5
10
30
1.54
3991544--3991685
57
2.5
57
85
1
185
41
16
19
21
1.90
3991602--3991634
12
2.8
12
100
0
66
42
15
24
18
1.88
3992670--3992713
6
7.2
6
81
2
52
0
25
0
75
0.81
3992670--3992713
12
3.6
12
87
3
61
0
25
0
75
0.81
3992675--3992709
18
1.9
18
94
0
61
0
28
0
71
0.86
3992670--3992724
24
2.2
24
84
9
67
0
29
1
69
0.99
3992762--3992814
16
3.4
16
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10
65
24
7
0
67
1.16
3992961--3993023
33
1.9
33
87
9
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53
7
0
38
1.30
3993407--3993464
3
19.7
3
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58
1
0
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1.08
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19
3.3
19
83
16
78
57
1
0
40
1.08
3994557--3994584
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
3997258--3997282
3
8.3
3
100
0
50
32
0
32
36
1.58
4002471--4002514
3
14.7
3
100
0
88
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4018455--4018498
18
2.5
17
82
13
54
56
0
0
43
0.99
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2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
4022038--4022075
17
2.1
18
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9
60
47
0
0
52
1.00
4022002--4022118
62
1.9
61
87
3
171
37
5
1
55
1.32
4023850--4023905
28
2.1
25
83
9
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67
0
0
32
0.91
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53
2.8
53
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4
214
29
27
16
25
1.97
4043804--4043954
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
4049603--4049648
19
2.3
20
79
20
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65
0
2
32
1.05
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2
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2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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2.0
20
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0
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4
7
46
1.53
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15
2.0
16
93
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55
45
0
3
51
1.17
4074295--4074344
14
3.4
14
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5
55
46
4
4
46
1.40
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32
2.2
33
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7
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35
16
2
45
1.61
4086197--4086286
45
2.0
45
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0
117
26
7
18
46
1.76
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16
1.9
16
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0
53
9
16
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1.39
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16
2.1
16
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0
50
8
20
8
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1.52
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17
2.2
17
90
0
58
31
7
5
55
1.51
4100710--4101081
130
2.9
130
82
0
431
28
18
18
33
1.95
4104919--4105069
53
2.8
53
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4
214
29
27
16
25
1.97
4112435--4112585
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
4122537--4122599
24
2.6
24
80
9
67
25
4
6
63
1.38
4122558--4122614
24
2.4
24
81
0
69
26
3
8
61
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4122832--4122885
2
28.5
2
78
10
51
38
0
1
59
1.08
4122832--4122886
12
4.6
13
80
19
57
38
0
1
60
1.08
4122807--4122902
23
4.0
24
76
15
83
37
4
2
56
1.30
4123063--4123129
3
22.0
3
76
14
66
31
5
1
61
1.29
4123061--4123129
26
2.7
25
82
13
79
31
5
1
60
1.29
4124539--4125802
631
2.0
631
99
0
2501
33
13
21
31
1.91
4132682--4132744
24
2.6
24
80
9
67
25
4
6
63
1.38
4132703--4132759
24
2.4
24
81
0
69
26
3
8
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1.42
4133736--4134999
631
2.0
631
98
0
2465
34
13
21
31
1.91
4140421--4140586
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345