Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  345  ( 41379 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1939343--1939508
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1
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0
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3.0
30
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99
10
17
15
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1951459--1951634
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20
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2.2
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0
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11
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18
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3
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28
0
0
71
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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3.1
30
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16
16
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22
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4
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0
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3.2
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10
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20
4.5
20
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17
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0
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0
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2.0
21
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0
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26
14
26
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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0
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0
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0
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30
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2.0
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0
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0
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15
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0
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0
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0
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1
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16
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13
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16
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17
58
42
0
2
55
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2184995--2185053
31
1.9
31
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10
86
42
0
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19
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19
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0
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2.4
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9
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2
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0
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0
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39
0
1
59
1.06
2221786--2221842
15
3.9
15
90
2
89
36
0
12
50
1.40
2222226--2222300
21
3.4
23
78
12
86
13
20
26
40
1.89
2222306--2222342
19
1.9
19
88
0
56
21
21
24
32
1.98
2224401--2224497
35
2.8
35
93
0
167
30
8
25
35
1.85
2224405--2224570
35
4.6
35
81
10
156
33
10
22
33
1.89
2235348--2235400
25
2.1
25
100
0
106
18
13
7
60
1.56
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34
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6
9
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1.21
2242242--2242392
53
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53
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25
15
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26
26
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1.91
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28
2.6
28
88
0
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27
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1.93
2262648--2262680
4
8.2
4
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10
50
0
0
27
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24
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65
4
0
29
1.11
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2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
31
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6
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45
10
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22
2.2
22
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0
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18
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10
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1.55
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2.2
17
100
0
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5
0
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1.18
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64
2.1
64
98
0
261
34
2
5
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1.36
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2.4
14
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0
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2
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1.25
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0
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0
0
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0.91
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2.0
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10
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1
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0
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0
0
100
0.00
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2.0
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1
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18
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2.4
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1.88
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0
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25
0
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3
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16
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3
2
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0
0
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4
1
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1.20
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17
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1
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0
0
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1.34
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0
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0
0
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0
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0
0
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2
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2.4
15
100
0
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1.68
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25
2.9
25
90
9
109
76
12
2
7
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2340465--2340542
28
2.9
26
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104
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12
2
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1.09
2340736--2340774
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2.3
17
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17
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0
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0
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0
0
60
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2.2
25
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100
0
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0
0
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2.1
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0
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2.0
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0
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20
2.2
20
88
8
63
50
2
0
47
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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