Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  197  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56181556--56181589
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16
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0
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2.0
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0
1.00
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1.8
124
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1
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10
23
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
80
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2.00
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2.6
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27
2.6
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2
131
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27
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0
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9
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29
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26
29
17
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1.8
143
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15
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2.2
17
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56
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5
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16
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.2
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1.96
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2.0
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20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
29
22
20
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1.9
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96
0
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29
22
20
1.99
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0
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5
68
23
18
20
38
1.93
56423798--56423858
27
2.3
27
82
2
70
26
16
24
32
1.96
56430182--56430239
24
2.4
24
85
2
80
15
18
22
43
1.88
56432404--56432502
44
2.3
42
80
10
110
27
17
23
32
1.96
56432411--56432558
42
3.4
44
77
10
126
25
16
25
32
1.96
56433853--56433891
19
1.9
20
85
15
53
35
0
17
46
1.49
56436138--56436316
40
4.4
40
88
0
241
26
22
26
24
2.00
56443221--56443344
44
2.9
43
81
7
153
25
16
25
32
1.96
56443214--56443359
43
3.4
41
79
10
159
28
16
23
32
1.96
56445110--56445283
46
3.7
46
75
10
149
29
19
27
23
1.98
56456760--56456835
38
2.0
38
97
0
143
23
17
18
40
1.91
56460515--56460682
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
56474253--56474424
93
1.8
93
94
0
308
28
29
20
20
1.98
56474245--56474420
46
3.8
46
79
12
216
29
28
20
21
1.98
56478552--56479042
44
10.6
44
66
17
160
33
17
19
29
1.95
56478507--56478760
138
1.8
138
83
3
341
30
18
22
29
1.97
56478594--56479176
188
3.1
189
83
3
687
34
17
18
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56478824--56479182
50
7.6
48
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21
186
33
18
16
31
1.93
56478593--56479190
282
2.1
282
80
3
650
34
17
18
29
1.94
56478594--56479191
94
6.4
94
80
2
567
34
17
18
29
1.94
56479055--56479201
50
3.1
49
71
17
146
37
19
14
28
1.91
56482352--56482378
14
1.9
14
100
0
54
44
7
0
48
1.31
56482351--56482385
14
2.4
14
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4
52
54
5
0
40
1.24
56482665--56482768
52
2.0
52
100
0
208
23
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28
30
1.97
56493595--56493632
18
2.1
19
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5
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55
0
0
44
0.99
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1.9
291
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635
42
9
12
35
1.75
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46
3.7
46
77
4
195
21
20
28
28
1.98
56498650--56498820
93
1.8
93
94
0
306
21
21
29
28
1.98
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2.8
47
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10
162
28
30
21
20
1.98
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30
2.0
30
87
6
86
28
25
6
40
1.80
56510039--56510151
25
4.6
25
68
7
70
34
20
24
20
1.96
56512898--56513004
20
5.8
18
70
18
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50
4
2
42
1.37
56516369--56516420
24
2.2
24
85
0
68
17
15
3
63
1.45
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80
1.9
80
80
4
174
22
29
25
22
1.99
56519172--56519279
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
56528331--56528479
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
56528372--56528479
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
56535064--56535160
16
6.2
16
66
22
55
69
2
2
26
1.11
56535095--56535186
22
4.0
24
72
18
70
65
0
2
32
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56535166--56535199
13
2.6
13
90
0
50
58
2
0
38
1.13
56546293--56546331
19
2.1
19
100
0
78
43
10
0
46
1.37
56546643--56546692
7
7.0
7
88
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73
18
0
38
44
1.50
56550033--56550152
46
2.6
46
94
0
204
30
31
19
19
1.96
56557776--56557960
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2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
56557777--56557968
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4.8
40
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7
151
24
24
28
22
2.00
56557776--56557993
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2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
56565800--56565981
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83
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221
24
24
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23
2.00
56565853--56565991
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3.5
40
82
8
151
25
25
28
21
1.99
56567821--56567958
40
3.5
40
76
4
102
25
27
21
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345