Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  345  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102752607--102752649
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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11
23
32
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2.0
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2.5
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40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2
65
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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14
1.9
14
100
0
54
44
3
0
51
1.19
102959982--102960027
19
2.4
18
82
10
56
34
17
6
41
1.75
102967086--102967234
73
2.0
73
100
0
298
31
12
23
32
1.92
102969183--102969243
22
2.8
21
79
16
61
19
1
4
73
1.10
102969226--102969276
17
3.0
16
77
11
57
23
5
0
70
1.09
102969226--102969275
19
2.9
18
69
19
52
22
6
0
72
1.07
102969909--102969977
25
3.0
22
82
12
75
33
20
26
20
1.97
102969927--102969988
25
2.5
25
97
0
115
37
19
20
22
1.95
102971455--102971486
3
10.7
3
100
0
64
65
0
0
34
0.93
102971459--102971550
12
7.2
12
68
20
53
59
3
1
35
1.21
102972412--102972536
64
2.0
64
95
0
223
22
22
12
42
1.87
102972881--102972929
18
2.7
17
84
12
62
28
2
0
69
1.00
102989505--102989671
35
4.6
35
82
8
183
32
10
23
33
1.89
102989516--102989632
40
3.0
40
83
10
131
32
10
23
33
1.89
102989505--102989675
75
2.4
74
84
7
217
32
11
22
33
1.89
102990811--102990943
48
2.8
46
83
12
148
21
30
21
27
1.98
102998771--102998833
30
2.1
30
91
5
101
61
9
3
25
1.41
103016822--103016848
6
4.5
6
100
0
54
33
33
14
18
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103024749--103024922
89
2.0
89
95
0
312
27
14
13
45
1.82
103025818--103025863
20
2.3
20
100
0
92
26
8
21
43
1.81
103042029--103042242
116
1.8
117
92
1
367
23
10
11
54
1.68
103042340--103042434
42
2.3
42
81
0
118
25
30
11
32
1.91
103042555--103042608
16
3.4
16
79
5
74
24
25
22
27
2.00
103042552--103042634
31
2.7
31
84
3
105
21
24
25
28
1.99
103050015--103050049
16
2.2
16
94
0
61
8
5
34
51
1.56
103054272--103054420
78
1.9
78
88
2
228
26
24
22
26
2.00
103055146--103055290
72
2.0
71
98
1
281
26
15
11
47
1.78
103063529--103063717
52
3.6
53
80
4
197
24
17
28
30
1.97
103063586--103063723
53
2.6
52
76
8
129
23
16
29
30
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345

The End!