Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  77  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21136308--21136369
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0
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2.5
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2.0
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43
0
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41
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20
2.8
19
86
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65
40
0
5
53
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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18
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29
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2.2
13
100
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19
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50
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16
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16
88
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50
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22
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284
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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43
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22
2.0
21
83
12
54
34
2
4
59
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21375985--21376018
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18
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0
0
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2.3
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85
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28
19
25
26
1.99
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21
1.9
22
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2
31
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51
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0
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1.37
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37
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4
35
1.60
21392397--21392507
47
2.4
47
77
11
129
36
20
14
27
1.92
21393356--21393388
13
2.6
13
95
4
59
57
0
0
42
0.98
21394524--21394559
2
18.5
2
88
5
56
50
0
0
50
1.00
21400279--21400435
51
3.1
50
91
1
251
31
15
23
29
1.95
21401969--21402005
20
1.9
18
89
10
56
43
0
21
35
1.53
21405027--21405193
46
3.6
45
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6
185
25
19
32
22
1.98
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46
3.6
44
85
8
184
23
20
31
24
1.98
21408013--21408049
20
1.9
18
89
10
56
43
0
21
35
1.53
21411066--21411232
46
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45
83
6
185
25
19
32
22
1.98
21411115--21411275
46
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44
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8
184
23
20
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24
1.98
21414026--21414062
20
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18
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0
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25
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37
0
1
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1.07
21424558--21424600
19
2.3
19
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0
50
48
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13
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21425729--21425769
18
2.3
18
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0
73
29
29
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1.89
21430806--21430849
15
2.9
15
96
0
79
15
13
13
56
1.67
21437208--21437244
17
2.2
16
95
4
65
40
0
5
54
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21437221--21437318
42
2.3
42
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3
126
40
2
3
54
1.28
21444344--21444401
21
2.9
21
84
5
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17
27
13
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1.87
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2
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2
100
0
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0
50
0
1.00
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9
12.7
9
70
23
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30
5
1
62
1.28
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11
5.0
11
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5
0
60
1.20
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20
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19
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19
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1
64
1.24
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0
0
42
0.98
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43
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1.94
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2.0
26
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0
95
26
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1.97
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2.3
23
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8
0
51
1.33
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2.3
30
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36
8
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1.32
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2.0
15
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0
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0
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1.20
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23
2.0
22
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25
1.86
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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18
100
0
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5
0
22
1.07
21483495--21483539
18
2.6
16
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16
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0
24
1.20
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2
20.5
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0
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0
0
48
1.00
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1.9
26
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8
75
54
8
6
32
1.54
21504843--21504894
18
2.8
19
79
2
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63
5
0
30
1.18
21505257--21505303
20
2.3
20
76
16
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29
4
0
65
1.11
21505257--21505304
21
2.4
20
80
13
55
29
6
0
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1.18
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44
2.0
44
100
0
180
35
11
11
42
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21512379--21512428
22
2.3
22
96
0
91
34
20
8
38
1.82
21514075--21514151
32
2.4
32
84
4
93
25
11
23
38
1.89
21514137--21514213
33
2.3
33
95
0
136
38
9
18
33
1.82
21520030--21520075
23
2.0
24
86
4
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60
2
4
32
1.28
21527007--21527102
11
7.8
12
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2
3
31
1.21
21527019--21527081
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2.7
23
73
9
63
68
1
1
28
1.08
21526985--21527081
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2.3
43
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10
101
63
3
4
28
1.27
21527026--21527080
18
3.0
17
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1
1
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21527009--21527091
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2.8
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10
84
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2
2
28
1.17
21527047--21527109
10
6.5
10
71
14
51
63
1
1
33
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345