Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  192  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
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Indices
Period
Size
Copy
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Indels
Score
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2.0
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17
32
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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25
1.99
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1.99
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21
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1.99
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21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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72
13
65
10
17
12
58
1.61
54880764--54880934
46
3.7
47
76
10
181
29
28
19
22
1.98
54880769--54880938
93
1.8
92
87
3
252
29
29
19
21
1.98
54886197--54886420
40
5.6
40
89
2
344
24
21
28
25
1.99
54886197--54886453
80
3.2
80
86
5
335
25
21
27
25
1.99
54889548--54889734
40
4.7
40
88
2
261
26
28
20
24
1.99
54889528--54889738
80
2.7
79
86
4
300
27
27
20
24
1.99
54897634--54897833
40
5.1
40
87
5
266
27
29
20
23
1.98
54905735--54905951
40
5.5
40
86
3
280
26
22
26
24
2.00
54912018--54912047
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
54912014--54912076
27
2.3
26
76
10
63
38
0
11
50
1.38
54914241--54914281
20
2.0
20
100
0
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24
36
34
4
1.77
54915752--54915807
11
5.3
10
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6
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12
3
1
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0.88
54915752--54915807
21
2.7
20
83
10
67
12
3
1
82
0.88
54915750--54915815
16
3.9
17
78
11
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15
3
1
80
0.91
54917234--54917263
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
54917230--54917292
27
2.3
26
76
10
63
38
0
11
50
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54917288--54917319
10
3.3
10
95
4
57
31
6
0
62
1.20
54921320--54921361
2
21.0
2
90
0
66
50
4
0
45
1.23
54926845--54927140
48
6.2
48
95
0
529
32
29
6
32
1.83
54926887--54927379
96
5.1
96
88
5
360
30
28
7
33
1.84
54926845--54927424
192
3.0
192
81
10
538
30
29
7
32
1.85
54927132--54927424
47
6.1
47
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3
498
28
29
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1.86
54927133--54927414
143
2.0
144
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2
514
29
29
8
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1.87
54927132--54927424
96
3.1
94
93
3
507
28
29
8
33
1.86
54932557--54932609
18
2.8
18
75
18
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60
1
7
30
1.35
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4.9
39
90
0
292
22
30
21
24
1.99
54946393--54946470
27
2.9
27
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0
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17
17
28
1.94
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3.9
51
75
12
167
39
20
9
29
1.84
54946455--54946666
27
7.9
27
79
8
184
39
20
9
29
1.85
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41
2.9
41
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0
177
23
20
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1.99
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2.4
22
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6
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21
26
23
28
1.99
54951438--54951489
26
2.0
26
92
0
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26
19
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28
1.98
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20
2.2
20
84
7
56
44
2
13
40
1.56
54954882--54954927
20
2.3
20
84
0
56
50
2
10
36
1.50
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39
4.2
39
91
0
254
26
31
18
23
1.97
54968340--54968532
39
4.9
39
90
0
251
23
31
21
23
1.98
54968370--54968532
39
4.2
39
93
0
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24
31
20
23
1.98
54970584--54970623
20
2.0
20
85
0
53
17
7
27
47
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54973580--54973727
52
2.9
51
90
4
228
27
29
14
28
1.96
54978002--54978091
27
3.3
27
89
3
137
38
16
11
33
1.84
54978002--54978107
54
2.0
53
87
9
153
37
18
11
32
1.87
54978086--54978145
26
2.3
26
88
0
84
36
26
6
30
1.82
54978097--54978162
26
2.5
26
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2
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27
28
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1.80
54978120--54978200
38
2.2
37
90
2
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24
29
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39
1.80
54978156--54978290
27
5.0
27
86
0
180
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20
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54
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0
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1.82
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27
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27
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9
162
41
21
8
28
1.82
54978156--54978316
81
2.0
81
80
0
178
31
20
8
39
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345