Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  106  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28544808--28544880
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2
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2.0
110
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1.15
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21
2.3
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257
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4.1
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22
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28591568--28591675
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2.0
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22
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0
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25
2.5
26
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75
75
1
8
14
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.13
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31
3.8
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26
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1.94
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25
3.2
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1
117
22
22
23
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1.99
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3.4
31
91
0
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25
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24
23
22
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2.00
28612112--28612206
25
3.8
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25
24
24
26
2.00
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6.0
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0
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2.0
101
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2.0
43
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12
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28640216--28640346
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2.8
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2.9
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78
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2.0
64
92
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21.9
44
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8
318
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17
25
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1
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17
25
26
1.97
28656042--28657025
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2.8
353
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17
25
26
1.97
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2.0
13
100
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2.4
45
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16
29
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1.97
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11
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2.0
252
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18
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0
0
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4
87
12
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27
24
27
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28703209--28703241
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66
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100
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0
63
1.16
28709918--28709952
16
2.1
17
94
5
63
28
25
17
28
1.97
28712742--28712783
20
2.1
20
86
8
59
64
0
7
28
1.20
28713727--28713764
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
28715609--28715640
2
16.0
2
93
0
55
50
3
0
46
1.17
28715600--28715640
10
4.1
10
93
0
55
48
7
0
43
1.30
28715601--28715639
8
4.9
8
93
0
51
51
7
0
41
1.31
28720997--28721131
60
2.2
60
80
7
141
40
13
7
39
1.72
28725096--28725316
46
4.9
47
73
11
160
28
24
19
27
1.99
28725130--28725630
132
3.8
132
89
1
779
26
23
21
28
1.99
28725142--28725625
264
1.8
265
95
0
871
26
23
21
28
1.99
28749638--28749857
43
4.9
47
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12
160
28
24
19
27
1.98
28749672--28750171
132
3.8
131
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23
21
28
1.99
28749684--28750166
264
1.8
265
94
0
862
26
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1.99
28767477--28767508
2
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2
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0
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0
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50
1.00
28770198--28770268
16
4.4
16
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3
99
36
4
28
30
1.76
28770199--28770268
32
2.2
32
92
5
115
37
2
28
31
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28770250--28770338
44
2.0
44
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8
117
33
5
23
37
1.78
28770428--28770586
58
2.8
57
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4
162
54
4
0
40
1.25
28776352--28776403
25
2.1
25
100
0
104
19
7
38
34
1.80
28776863--28776901
19
2.0
20
90
5
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20
0
7
71
1.10
28776882--28776927
25
1.9
23
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28
0
8
63
1.24
28782486--28782539
18
3.3
18
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22
48
7
22
1.75
28782476--28782544
30
2.3
30
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0
120
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5
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1.68
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3.5
23
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54
1.43
28783087--28783163
2
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1
54
1.27
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54
2.1
54
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7
144
38
5
3
52
1.41
28783089--28783165
25
3.0
26
79
9
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38
3
1
55
1.26
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25
5.0
25
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15
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35
3
3
56
1.36
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25
3.8
24
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14
75
32
5
5
56
1.44
28783178--28783240
26
2.4
25
84
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30
4
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1.43
28783222--28783280
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1.48
28783395--28783429
16
2.3
15
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2
2
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1.24
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2.0
27
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20
1
3
1.08
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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3.0
12
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27
25
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1.77
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2.1
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218
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16
18
33
1.94
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1.8
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88
3
251
31
16
18
33
1.93
28795696--28796038
75
4.6
73
85
6
467
31
16
20
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28795532--28795996
165
2.9
161
79
12
557
31
16
19
32
1.94
28795695--28796038
147
2.3
150
89
4
511
31
16
20
31
1.95
28796893--28796957
24
2.7
24
77
13
62
76
15
4
3
1.07
28796887--28796956
27
2.5
28
88
8
108
75
17
4
2
1.08
28797668--28797709
14
3.0
14
79
10
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30
0
7
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1.22
28797742--28797816
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19
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2.3
15
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0
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32
1.94
28804464--28805123
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4.5
148
93
1
1080
30
16
20
32
1.94
28805218--28805250
14
2.4
14
90
10
50
21
12
6
60
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345