Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  3  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.5
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2.2
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2.0
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856688--856789
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3.4
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18
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3.0
60
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2.0
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0
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0
0
50
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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53
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2
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1.13
895212--895251
20
1.9
22
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10
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35
0
7
57
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1.9
26
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932225--932299
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1.9
19
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0
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20
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2
2
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2.1
23
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1.66
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33
2.0
33
87
6
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20
4
30
44
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
18
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2.0
28
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29
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2.0
30
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6
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1
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1
1
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17
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1.76
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11
3.6
11
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20
53
43
5
0
51
1.24
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2.2
19
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4
0
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1.21
1035980--1036015
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5
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1.40
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0
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58
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1.07
1040223--1040289
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1
0
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13
24
27
1.93
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5.5
39
93
1
353
28
29
23
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1063480--1063546
29
2.3
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5
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46
2
1
49
1.26
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3.2
30
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5
97
35
6
12
46
1.67
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29
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5
99
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2
34
1.45
1064698--1064780
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15
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8
2
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1.45
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2.0
22
81
4
52
34
2
2
61
1.21
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2
13.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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2
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15
14
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0
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1.9
27
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68
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8
8
54
1.58
1087025--1087066
18
2.3
19
83
8
59
66
2
0
30
1.04
1091408--1091447
19
2.1
19
100
0
80
37
0
5
57
1.21
1100176--1100205
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
1107797--1107843
24
1.9
25
83
12
62
14
6
14
63
1.49
1111390--1111447
22
2.6
23
83
10
75
56
0
3
39
1.16
1113088--1113114
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
1114992--1115034
20
2.0
20
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8
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76
6
2
13
1.08
1119502--1119532
14
2.1
15
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5
55
22
19
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1.69
1123163--1123192
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
1125700--1125763
29
2.2
29
81
13
78
48
4
6
40
1.49
1125700--1125767
30
2.2
29
82
10
73
48
4
5
41
1.47
1125901--1125950
19
2.7
19
90
3
75
46
0
0
54
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1127024--1127191
46
3.6
45
78
15
191
27
27
21
22
1.99
1127027--1127197
93
1.8
93
93
0
297
28
28
21
22
1.99
1127071--1127213
46
3.1
45
73
15
123
29
28
19
22
1.98
1134590--1134666
28
2.7
29
80
8
86
42
3
2
50
1.34
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2
15.0
2
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0
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0
0
50
1.00
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29
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3
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0
1
32
1.03
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10
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10
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73
2
2
21
1.07
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2
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2
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0
61
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0
0
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1.00
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2.7
18
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1
5
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1.38
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2.0
75
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4
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38
12
24
24
1.90
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3.0
39
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7
134
55
10
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1.59
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20
5.8
20
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9
83
54
9
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27
1.62
1161660--1161689
14
2.1
14
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0
51
16
0
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46
1.47
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2
0
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1.07
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19
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53
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26
1.65
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40
2.2
40
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11
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13
28
1.67
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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2.6
17
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31
2
0
66
1.04
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24
2.0
24
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4
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48
0
0
51
1.00
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26
3.6
26
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0
150
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29
1.91
1173364--1173417
24
2.3
23
75
12
56
24
0
3
72
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1173554--1173596
17
2.4
18
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11
54
27
2
0
69
1.00
1174560--1174605
13
3.5
13
82
5
65
36
0
4
58
1.18
1174555--1174610
27
2.1
27
100
0
112
42
0
3
53
1.18
1174555--1174610
13
4.2
13
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58
42
0
3
53
1.18
1177370--1177402
2
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2
100
0
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0
48
0
1.00
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20
0
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18
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0
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0
0
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2.0
23
86
4
65
67
0
0
32
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345