Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  307  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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9
10
34
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
92562540--92562580
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100
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19
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10
1.35
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5
799
27
6
7
59
1.48
92576007--92576054
16
3.1
16
82
14
64
2
33
0
64
1.05
92601277--92601330
27
2.0
27
92
7
92
12
59
3
24
1.50
92601409--92601448
21
1.9
21
94
0
71
12
70
2
15
1.28
92601412--92601461
21
2.4
21
82
0
55
14
72
2
12
1.22
92603034--92603079
3
15.3
3
90
0
74
28
0
2
69
1.00
92603554--92603615
17
3.7
16
76
23
56
29
4
1
64
1.23
92603546--92603601
26
2.2
26
87
6
78
25
5
1
67
1.21
92603581--92603612
16
1.9
17
93
6
57
31
3
0
65
1.08
92604930--92604976
22
2.1
22
100
0
94
46
21
14
17
1.83
92606447--92606481
16
2.2
16
90
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54
45
0
2
51
1.16
92607398--92607434
2
19.0
2
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51
0
0
48
1.00
92607434--92607483
2
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2
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0
100
0
0
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50
1.00
92607912--92607936
12
2.1
12
100
0
50
16
24
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40
1.91
92608158--92608231
18
4.1
18
77
3
76
31
8
14
45
1.74
92609181--92609215
18
1.9
18
94
0
61
14
5
14
65
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92624887--92625018
60
2.2
59
89
4
194
34
16
8
40
1.79
92627925--92627963
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
92647238--92647419
46
4.0
46
89
1
240
21
23
14
40
1.91
92650710--92651074
47
7.7
48
70
14
188
30
18
27
24
1.97
92650707--92650879
92
1.9
94
89
4
271
29
19
28
23
1.98
92664338--92664375
18
2.2
18
86
9
53
57
2
2
36
1.26
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2
24.5
2
93
4
80
54
0
0
45
0.99
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2.5
20
78
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57
56
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1
31
1.43
92665264--92665342
20
3.8
22
70
23
64
59
5
1
34
1.27
92665264--92665371
22
5.0
23
68
21
63
62
4
2
30
1.30
92665272--92665336
18
3.4
20
76
18
59
61
3
1
33
1.21
92665264--92665345
21
4.0
20
73
23
73
60
4
1
32
1.25
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19
2.1
19
85
0
51
61
5
7
25
1.44
92665454--92665530
3
25.7
3
94
0
136
64
1
1
32
1.09
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2.8
12
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13
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9
6
0
84
0.76
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2
16.5
2
93
0
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45
0
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51
1.16
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14
2.1
14
100
0
58
27
13
13
44
1.82
92677220--92677326
30
3.6
30
77
8
110
42
23
4
28
1.74
92677228--92677371
30
4.6
30
70
14
87
45
19
2
31
1.64
92679320--92679353
6
5.7
6
92
0
50
17
23
0
58
1.38
92679320--92679354
18
1.9
18
94
0
61
17
22
0
60
1.37
92683092--92683192
28
3.5
29
83
6
116
30
27
12
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92687457--92687506
24
2.0
25
88
3
75
30
24
20
26
1.98
92687547--92687585
10
3.8
10
93
6
69
33
17
17
30
1.94
92687546--92687585
21
1.9
21
100
0
80
35
17
17
30
1.93
92695283--92695333
25
2.0
25
88
0
75
29
23
19
27
1.98
92695374--92695412
10
3.8
10
93
6
69
33
17
17
30
1.94
92695373--92695412
21
1.9
21
100
0
80
35
17
17
30
1.93
92696588--92696803
43
5.0
43
87
4
310
29
28
17
24
1.97
92697363--92697392
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2.0
15
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0
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16
0
26
1.40
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4.7
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6
94
34
11
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30
1.90
92699708--92699802
32
3.0
31
80
6
100
31
9
23
35
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345