Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  71  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19423700--19423781
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2.0
41
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0
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22
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0
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2.6
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1.82
19426870--19427185
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1.80
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2.2
22
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22
28
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2.0
22
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0
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2.00
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1.9
119
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27
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2.00
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70
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20
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2.1
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0
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20
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2.0
77
93
0
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30
24
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
0
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2.0
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2
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0
0
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57
5
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58
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17
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370
33
18
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19483613--19483653
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2.2
31
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3.4
43
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1.98
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2.2
42
81
0
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16
26
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2.2
22
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11
62
23
0
4
71
1.03
19492143--19492187
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6.4
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0
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51
26
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7
14.1
7
74
6
58
39
37
2
21
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19492306--19492356
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2.2
22
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41
33
2
22
1.66
19492423--19492457
15
2.4
15
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48
31
0
20
1.50
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3.1
39
74
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111
24
19
24
30
1.98
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2
100
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50
0
0
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2.2
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2
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51
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5
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56
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
19533822--19533856
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20
94
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5
0
39
1.23
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64
39
4
0
56
1.21
19557905--19557948
18
2.3
18
84
11
52
68
6
0
25
1.14
19567053--19567084
13
2.4
14
94
5
57
56
18
25
0
1.42
19568098--19568189
25
3.6
25
73
11
80
22
3
6
67
1.29
19568218--19568349
29
4.7
26
70
20
88
29
6
3
59
1.41
19568298--19568356
26
2.1
27
81
9
66
27
10
1
61
1.38
19570361--19570511
53
2.8
53
89
4
214
30
28
15
25
1.96
19578952--19579073
46
2.6
45
86
8
149
33
14
20
31
1.93
19579102--19579807
44
15.6
44
75
11
364
30
18
23
28
1.97
19579234--19579762
183
2.9
182
80
8
507
30
17
22
29
1.97
19579190--19579821
234
2.7
231
82
8
661
31
17
22
28
1.97
19580189--19580231
17
2.5
17
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3
50
46
34
2
16
1.60
19580349--19580380
13
2.4
14
94
5
57
56
18
25
0
1.42
19581400--19581467
28
2.4
29
78
7
77
23
4
4
67
1.27
19581530--19581636
29
3.8
28
72
16
94
28
5
3
62
1.35
19581521--19581649
57
2.3
55
80
10
154
29
6
3
60
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19581632--19581679
22
2.2
22
84
0
60
29
10
6
54
1.59
19581655--19581711
27
2.1
27
83
6
71
26
5
7
61
1.43
19585391--19585450
30
2.0
30
90
6
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36
6
25
31
1.82
19585870--19586029
82
2.0
82
89
0
248
22
20
26
30
1.98
19587908--19587942
17
2.1
17
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5
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2
8
0
0.61
19595743--19596006
71
3.7
69
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6
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25
14
22
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1.92
19595885--19596131
122
2.0
124
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383
24
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22
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1.90
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2.3
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1.93
19596006--19596446
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36
1.94
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2.9
74
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250
27
17
23
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1.97
19596472--19597144
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18
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29
18
19
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3.9
166
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2
933
28
18
20
32
1.96
19596473--19597144
239
2.8
225
75
17
567
29
18
19
31
1.96
19596805--19597310
79
6.5
73
75
13
404
29
16
18
34
1.94
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73
14
431
28
16
18
35
1.93
19597292--19597353
30
2.1
30
90
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19
9
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41
1.83
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253
2.3
247
85
5
758
28
16
18
36
1.93
19598165--19598201
17
2.2
17
90
4
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89
2
8
0
0.58
19598168--19598201
12
2.9
11
91
8
50
88
2
8
0
0.62
19598197--19598233
16
2.3
16
85
0
56
62
29
0
8
1.24
19598917--19598997
27
3.1
27
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20
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37
6
7
49
1.56
19598901--19599008
50
2.1
50
98
1
207
38
5
5
50
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19603238--19603288
11
4.5
11
76
13
50
74
1
0
23
0.92
19603238--19603284
6
7.8
6
81
9
51
74
2
0
23
0.93
19603230--19603288
23
2.6
22
81
7
73
74
1
1
22
1.00
19603899--19603972
33
2.2
33
97
0
139
10
33
32
22
1.89
19604320--19604387
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2.3
30
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5
84
47
5
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1.72
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46
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0
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14
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19606496--19606768
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3.0
92
89
0
420
40
14
23
21
1.90
19606510--19606773
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138
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1
413
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20
1.90
19615845--19616165
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2.5
128
85
6
409
26
16
20
36
1.94
19620083--19620113
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345