Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  88  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Score
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28
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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117
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12
5
32
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24239627--24239664
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5.4
7
96
0
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0
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1.43
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79
7
50
16
0
32
50
1.46
24240029--24240080
14
3.6
14
76
5
50
17
3
34
44
1.67
24240100--24240166
34
1.9
35
85
8
93
11
0
32
55
1.37
24240148--24240194
23
2.1
22
84
4
58
19
0
31
48
1.49
24240966--24240992
14
1.9
14
100
0
54
18
0
37
44
1.50
24240140--24241838
869
2.0
869
93
0
2891
28
11
23
36
1.90
24242572--24242656
31
2.7
31
83
0
107
20
29
37
12
1.90
24243609--24243945
169
2.0
169
90
0
530
29
20
18
32
1.96
24249553--24249666
40
2.8
40
81
4
122
33
27
12
27
1.92
24254987--24255017
15
2.0
16
93
6
55
61
12
0
25
1.32
24255254--24255284
11
2.8
11
95
0
53
19
9
0
70
1.14
24255269--24255317
22
2.2
22
85
7
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20
16
6
57
1.60
24255355--24255419
30
2.2
30
94
0
112
24
7
13
53
1.66
24255500--24255539
18
2.2
18
86
8
55
20
0
12
67
1.22
24255541--24255573
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
24258766--24258835
33
2.1
33
94
0
122
41
7
18
32
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24266491--24266624
26
5.2
26
94
3
225
34
5
23
37
1.77
24268102--24268154
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
24268346--24268393
21
2.3
21
85
7
62
12
2
52
33
1.51
24272395--24272526
26
5.2
26
96
2
223
34
5
23
36
1.78
24272395--24272526
51
2.6
50
92
4
219
34
5
23
36
1.78
24273998--24274050
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
24274243--24274290
21
2.3
21
85
7
62
12
2
52
33
1.51
24276607--24276648
13
2.9
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0
0
45
0.99
24276611--24276647
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2.3
16
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13
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59
0
0
40
0.97
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2.1
47
96
0
176
27
14
19
38
1.91
24310681--24310713
14
2.2
16
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10
52
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0
0
30
0.88
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44
1.9
44
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4
107
36
23
19
20
1.95
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15
2.0
15
100
0
60
26
13
6
53
1.64
24319076--24319111
18
2.1
17
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5
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33
22
0
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2.0
26
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0
93
66
0
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1.25
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23
3.1
23
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4
110
45
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13
23
1.83
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21
2.6
21
94
0
92
18
49
14
18
1.80
24332059--24332186
64
2.0
64
96
0
238
25
24
14
36
1.92
24337972--24338124
76
2.0
76
97
0
288
37
11
13
37
1.80
24338334--24338359
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
24338462--24338511
23
2.1
24
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3
75
26
24
18
32
1.97
24339176--24339213
16
2.2
18
90
9
62
44
5
10
39
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24340784--24340817
17
2.0
17
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0
50
29
0
8
61
1.26
24341225--24341258
17
2.1
17
88
5
52
70
0
26
2
1.01
24342151--24342285
39
3.4
39
75
8
114
25
20
26
27
1.99
24342391--24342429
18
2.2
18
86
9
53
48
0
20
30
1.50
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20
1.9
20
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10
51
47
0
10
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1.38
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11
3.1
11
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0
50
14
8
14
61
1.55
24355931--24355978
24
2.0
24
84
11
64
41
6
0
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1.27
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19
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1.52
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.6
10
100
0
52
7
38
0
53
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345