Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  7  of  345  ( 41379 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2361547--2361662
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3.0
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0
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13
4
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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1.9
26
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0
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16
14
30
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
2
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2.1
17
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17
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0
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2.0
21
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4
59
61
0
2
35
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2612588--2612659
20
3.6
20
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58
1
2
37
1.21
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2
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2
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2.2
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2
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2
11
47
1.55
2620614--2620663
22
2.2
23
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10
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16
6
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0
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2
1
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0
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31
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5
84
51
8
2
36
1.48
2631495--2631536
21
2.0
21
95
0
75
50
9
11
28
1.70
2631892--2631946
18
3.2
17
78
17
51
40
1
12
45
1.53
2633282--2633306
3
8.3
3
100
0
50
36
0
32
32
1.58
2634447--2634473
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
2643584--2643622
20
2.0
20
94
0
69
43
0
0
56
0.99
2643987--2644040
27
1.9
27
85
7
72
33
9
0
57
1.31
2644242--2644303
25
2.4
25
78
2
70
40
1
3
54
1.26
2644390--2644452
25
2.5
25
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2
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65
11
4
19
1.42
2644964--2645021
29
1.9
31
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75
24
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5
63
1.40
2647745--2647799
23
2.5
22
83
13
76
45
0
7
47
1.30
2647934--2647975
16
2.4
19
73
23
54
45
11
4
38
1.62
2647941--2647975
16
2.2
16
94
0
61
42
14
5
37
1.69
2673046--2673089
23
2.0
23
86
4
63
45
0
4
50
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2673053--2673114
31
2.0
31
87
0
88
50
1
1
46
1.20
2674248--2674273
13
2.0
13
100
0
52
38
7
0
53
1.30
2678602--2678633
16
2.0
16
100
0
64
18
6
6
68
1.32
2680737--2680941
102
2.0
102
99
0
401
29
19
34
16
1.94
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44
2.6
44
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2
149
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13
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27
1.92
2685312--2685445
46
3.0
45
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4
153
35
14
23
26
1.93
2690619--2690979
183
2.0
185
94
1
645
29
25
18
26
1.98
2693293--2693326
17
2.0
17
88
0
50
29
2
0
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1.05
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22
1.9
22
90
5
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56
0
12
31
1.36
2694962--2695274
125
2.5
125
87
1
448
38
19
13
28
1.89
2695971--2696026
29
2.0
27
83
10
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60
1
1
35
1.17
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24
2.7
22
80
11
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59
1
11
27
1.41
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13
2.0
13
100
0
52
15
0
46
38
1.46
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6
9.3
6
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16
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20
0
0
80
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2.0
28
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20
0
0
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22
2.4
23
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14
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20
0
0
80
0.72
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2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
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31
2.8
30
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6
97
28
1
2
68
1.09
2705428--2705498
15
4.6
15
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5
70
25
1
2
70
1.09
2705465--2705514
8
6.4
8
78
17
52
28
0
2
70
0.99
2705428--2705519
16
5.9
15
74
20
66
29
1
2
67
1.09
2705449--2705519
17
4.4
16
77
12
65
28
1
1
69
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2709950--2710049
3
33.0
3
97
2
191
66
0
33
1
0.99
2710136--2710200
31
2.2
31
78
10
73
26
7
18
47
1.75
2714333--2714373
22
1.9
22
85
5
57
19
7
17
56
1.64
2717218--2717263
17
2.7
17
84
15
60
52
0
0
47
1.00
2724118--2724188
23
3.1
23
100
0
142
39
16
21
22
1.92
2725333--2725383
26
2.0
27
84
7
70
23
15
23
37
1.93
2726872--2726979
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4.2
26
91
0
180
36
23
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1.83
2728108--2728140
15
2.2
15
94
0
57
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6
0
30
1.18
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2.1
14
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6
51
51
0
0
48
1.00
2750677--2750853
50
3.5
50
90
0
282
35
15
23
25
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345