Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  324  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97098742--97098787
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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65
0
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33
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
A
C
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(0-2)
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30
3.0
30
90
0
128
28
15
31
24
1.95
97219074--97219196
50
2.5
50
90
0
192
17
25
24
32
1.97
97219101--97219180
25
3.2
25
63
7
63
15
23
25
36
1.93
97219212--97219294
24
3.4
24
72
8
69
16
26
20
36
1.94
97219280--97219335
25
2.2
25
78
6
60
21
23
25
30
1.99
97219995--97220167
73
2.4
73
86
0
238
24
27
25
23
2.00
97220588--97220695
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2.0
53
92
0
180
33
19
13
33
1.91
97221506--97221541
18
2.0
18
88
0
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16
5
50
1.68
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100
0
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13
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8
1.74
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125
2.6
125
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2
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38
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16
28
1.91
97223532--97223811
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1
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1.91
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0
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0
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1.00
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18
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1.47
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16
2.0
16
100
0
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0
0
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0.95
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2.5
15
88
8
60
64
0
0
35
0.94
97229484--97229566
21
4.1
21
70
17
59
24
1
2
72
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97229484--97229575
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4.7
20
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15
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23
1
2
72
1.02
97229483--97229578
38
2.5
38
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5
104
26
1
2
70
1.04
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21
2.0
21
95
5
73
50
0
2
47
1.14
97230201--97230329
9
14.2
9
70
4
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52
3
4
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1.38
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9
9.0
9
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53
1
3
41
1.26
97230257--97230331
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2.7
27
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1
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42
1.28
97230664--97230732
11
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11
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40
0
2
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1.14
97230662--97230732
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19
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79
40
0
2
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1.14
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2.0
20
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1.9
20
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0
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1.12
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0
5
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19
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0
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1.02
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2.0
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29
1.94
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2.5
27
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13
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1.88
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0
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0
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0
0
48
1.00
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1
23
1.14
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18
1.9
19
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44
5
5
44
1.50
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23
2.3
23
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0
59
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11
26
28
1.91
97293126--97293229
26
4.0
26
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113
24
17
26
31
1.97
97293127--97293228
52
2.0
52
86
3
143
23
17
26
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97315907--97315937
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
97316305--97316342
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2.0
20
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36
10
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44
1.68
97316718--97316774
24
2.4
24
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0
105
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5
0
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14
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0
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2.4
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40
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27
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34
3.2
34
98
1
209
28
6
11
53
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345