Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  315  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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3.0
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1.94
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Indels
Score
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1.98
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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Period
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1.98
94782870--94782909
19
2.1
19
90
0
62
35
0
7
57
1.27
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40
5.6
40
80
2
245
26
23
25
24
2.00
94793584--94793690
19
5.8
18
70
18
60
50
3
3
42
1.38
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46
4.8
47
77
12
212
27
20
29
22
1.98
94797247--94797466
97
2.4
92
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6
248
27
20
29
23
1.98
94809898--94810154
47
5.4
47
73
15
163
26
20
30
22
1.98
94809796--94810154
94
3.8
93
75
7
278
25
20
30
22
1.98
94809939--94810063
44
2.8
45
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8
130
25
20
28
25
1.99
94810905--94811021
55
2.1
54
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6
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22
25
28
23
1.99
94814475--94814522
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3.5
13
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29
0
6
64
1.18
94817858--94817896
20
2.1
19
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0
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21
1.9
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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17
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17
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0
50
23
13
23
39
1.90
94827942--94827994
26
2.0
26
82
10
63
30
16
20
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
21
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12
73
31
12
22
33
1.91
94829283--94829360
41
1.9
41
100
0
156
34
12
20
32
1.90
94829285--94829349
20
3.2
20
70
12
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35
15
20
29
1.93
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29
1.9
29
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0
85
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0
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35
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1.96
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1.93
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0
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0
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0
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5
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0
0
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355
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3.4
84
94
0
482
28
25
21
24
1.99
94852723--94853025
127
2.4
125
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347
28
26
20
24
1.99
94853023--94853064
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2.0
20
86
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45
0
0
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0
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8
9.4
8
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9
60
29
1
1
67
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94857290--94857324
7
4.7
7
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37
2
0
60
1.12
94857249--94857326
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5.2
15
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1
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1.09
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1.60
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0
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0
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0
0
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21
2.9
22
79
6
76
40
25
18
15
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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