Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  53  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15124342--15124377
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2.3
23
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0
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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20
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178
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19
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22
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1.99
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20
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
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78
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21
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1.98
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2.4
18
88
3
61
53
0
13
32
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15203314--15203543
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10.4
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11
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73
19
93
60
0
11
27
1.35
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1.22
15203437--15203594
74
2.1
73
78
13
162
64
0
10
24
1.25
15203581--15203616
19
1.9
19
88
5
56
58
0
22
19
1.40
15203773--15203826
25
2.1
26
86
3
74
55
0
5
38
1.23
15203788--15203834
25
1.9
25
82
4
60
57
0
10
31
1.33
15203856--15203953
51
1.9
51
89
4
153
56
4
10
29
1.51
15203972--15204021
15
3.1
15
82
8
55
60
0
10
30
1.30
15203980--15204021
16
2.6
17
81
11
52
54
0
11
33
1.37
15203999--15204039
5
7.6
5
84
15
55
56
0
17
26
1.41
15203999--15204060
28
2.2
28
88
5
90
51
0
17
30
1.46
15204079--15204122
19
2.5
17
82
13
54
63
4
11
20
1.44
15204145--15204201
20
2.8
20
86
5
78
64
0
10
24
1.24
15204225--15204267
12
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12
78
12
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48
0
18
32
1.48
15208763--15208854
47
1.9
48
91
2
150
32
29
6
31
1.83
15210626--15210682
29
1.9
30
82
3
71
50
1
0
47
1.11
15213899--15213933
16
2.2
16
90
10
54
45
0
28
25
1.54
15213899--15213955
15
3.8
15
73
15
55
42
0
31
26
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15214592--15214624
13
2.5
13
86
13
50
57
3
0
39
1.14
15215932--15215973
16
2.4
18
76
11
52
50
0
2
47
1.14
15216211--15216277
22
3.0
22
68
20
66
38
10
0
50
1.37
15216854--15216889
16
2.2
17
90
5
56
55
0
0
44
0.99
15218344--15218496
24
6.2
24
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14
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34
39
16
8
1.80
15218404--15218472
27
2.7
27
86
6
99
34
42
14
8
1.77
15218422--15218472
15
3.6
15
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15
54
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13
9
1.76
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1.9
21
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0
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0
0
45
0.99
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27
2.1
26
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37
3
3
55
1.35
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345
3.0
345
99
0
2034
35
12
20
31
1.90
15224135--15224307
43
4.0
44
80
15
209
23
18
26
31
1.98
15224164--15224288
42
2.9
42
82
12
123
23
18
26
32
1.97
15225553--15225577
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
15225550--15225622
29
2.5
31
80
6
89
58
4
0
36
1.17
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23
1.9
23
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54
4
0
40
1.21
15228725--15228762
20
1.9
20
88
0
58
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7
5
34
1.53
15228788--15228819
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2.6
12
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5
55
75
0
9
15
1.05
15228862--15228895
13
2.5
13
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4
50
58
2
38
0
1.13
15228873--15228906
17
2.1
17
94
5
61
64
0
35
0
0.94
15230197--15230238
5
8.2
5
86
2
57
40
0
19
40
1.51
15230647--15230886
45
5.3
45
88
1
311
18
17
21
41
1.90
15231064--15231256
18
10.7
18
75
12
137
34
11
16
37
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15231054--15231256
72
2.8
70
79
8
230
35
11
15
37
1.84
15231295--15231336
18
2.3
18
87
0
57
38
11
16
33
1.86
15231066--15231336
36
7.3
36
68
12
154
34
12
16
36
1.86
15232838--15232885
17
2.7
18
80
6
53
54
0
0
45
0.99
15232896--15232930
17
2.1
17
89
5
54
28
0
8
62
1.24
15233563--15233593
15
2.1
15
100
0
62
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6
32
1.51
15234486--15234532
3
15.7
3
100
0
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0
0
34
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16
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59
0
0
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0.97
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29
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10
73
61
7
0
30
1.24
15244836--15244906
37
1.9
37
91
0
115
36
22
4
36
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345