Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  277  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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20
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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1.9
119
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0
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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103
21
22
19
38
1.94
82753699--82753799
46
2.1
49
87
8
147
20
24
18
35
1.95
82766567--82766827
40
6.6
40
81
7
273
24
26
23
25
2.00
82774760--82774984
40
5.6
40
82
2
272
24
26
24
25
2.00
82780977--82781152
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
82780974--82781145
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
82788556--82788730
45
3.8
46
79
13
216
20
20
29
29
1.98
82796049--82796126
12
6.8
12
74
10
74
2
1
30
65
1.14
82796049--82796122
23
3.2
22
88
5
94
2
1
28
67
1.12
82796066--82796150
22
3.7
23
81
7
93
4
3
27
64
1.29
82796076--82796155
34
2.4
34
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8
85
5
3
25
66
1.29
82796318--82796376
29
2.0
29
87
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18
0
8
72
1.09
82796342--82796385
21
2.1
21
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22
0
6
70
1.11
82796357--82796416
26
2.4
25
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28
0
6
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1.18
82797270--82797295
2
13.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
82803385--82803435
3
16.7
3
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4
84
68
0
0
31
0.90
82805425--82805495
19
3.8
19
88
7
110
38
11
14
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82805446--82805483
17
2.5
15
80
19
51
39
10
15
34
1.82
82805427--82805503
19
4.3
19
85
9
72
40
10
14
35
1.80
82811205--82811255
19
2.7
19
87
6
77
84
0
15
0
0.63
82811197--82811255
11
5.2
11
84
8
82
84
0
15
0
0.62
82811197--82811249
8
6.5
8
78
18
56
84
0
15
0
0.61
82811669--82811721
26
2.0
26
100
0
106
47
11
11
30
1.74
82812273--82812523
87
2.9
83
86
7
342
31
26
21
20
1.98
82812286--82812429
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3.3
44
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19
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20
18
1.96
82812330--82812474
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3.3
43
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20
22
1.98
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207
5.5
207
93
0
1844
30
17
23
29
1.97
82814166--82814221
18
3.5
15
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18
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37
10
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35
1.83
82814145--82814233
19
4.8
19
83
8
121
35
12
14
37
1.84
82814172--82814233
17
3.5
17
86
8
88
38
12
11
37
1.80
82815861--82815897
2
18.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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2
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0
0
48
1.00
82817006--82817109
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23
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1
2
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1.18
82817006--82817109
11
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12
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18
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65
1
2
29
1.18
82817004--82817137
20
7.1
19
69
18
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2
2
29
1.16
82817002--82817144
75
1.9
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80
12
168
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2
2
30
1.16
82817065--82817148
30
3.1
27
71
24
77
64
2
1
32
1.14
82818985--82819263
44
6.3
44
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0
387
27
27
13
30
1.95
82819414--82819529
40
2.7
42
82
9
137
27
25
14
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82829710--82829868
39
4.1
39
92
0
246
28
20
22
28
1.98
82835066--82835116
3
16.7
3
91
4
84
68
0
0
31
0.90
82835997--82836133
57
2.4
60
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10
191
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1
2
29
1.12
82835997--82836132
20
7.2
19
74
19
99
66
1
2
29
1.12
82835995--82836139
19
7.7
19
74
17
99
65
1
2
31
1.12
82852795--82852912
57
2.1
56
80
1
128
30
27
12
28
1.93
82852826--82852912
28
3.1
29
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5
133
28
27
14
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2.9
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77
20
17
22
39
1.92
82860955--82861047
23
3.8
24
73
13
75
24
18
19
37
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345