Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  15  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5100767--5100807
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19
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0
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29
2.0
29
83
6
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0
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1.24
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3
27.7
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1.21
5102261--5102318
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2.1
28
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0
0
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200
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2.0
16
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1.09
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2.5
25
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18
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68
1
3
27
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5166778--5166859
17
4.7
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18
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1.26
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6
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6
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0
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5169640--5169692
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2.3
23
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11
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10
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24
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1.93
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152
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13
24
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2.3
58
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5196318--5196487
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3.2
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24
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320
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22
19
1.85
5208869--5209153
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3.1
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268
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13
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3
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15
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0
0
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19
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71
27
0
0
72
0.85
5212225--5212264
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3.8
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12
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27
0
0
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14
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54
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1
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0
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100
0
0
0
0.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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80
0
58
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5
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21
1.31
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15
84
0
76
7
4
67
20
1.33
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12
4.9
12
80
0
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5
67
18
1.35
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90
0
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5
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51
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70
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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21
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0
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12
4.8
12
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12
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1
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1.23
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10
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32
0
6
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9
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5
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2
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18
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11
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2
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1.12
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16
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0
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4
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1.32
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2.0
22
87
8
65
60
2
2
35
1.22
5320361--5320430
34
2.1
34
100
0
140
38
20
14
27
1.91
5323608--5323665
14
3.7
16
80
15
68
50
1
0
48
1.11
5323606--5323665
9
6.4
9
70
14
50
50
1
0
48
1.11
5325522--5325567
20
2.3
20
85
7
58
58
0
4
36
1.18
5325885--5325965
41
2.0
41
82
4
101
46
9
0
43
1.37
5332715--5332761
17
2.7
18
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6
78
36
10
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1.78
5335371--5335403
13
2.5
13
100
0
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42
21
9
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1.83
5335692--5335757
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0
1
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0
0
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29
2.0
30
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3
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44
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12
36
1.68
5353747--5353795
17
2.8
17
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3
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24
4
0
71
1.03
5353748--5353806
17
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17
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9
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25
3
1
69
1.13
5355081--5355131
21
2.4
22
75
15
52
21
0
9
68
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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0
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0
0
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1
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1
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0
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0
0
0
100
0.00
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4.2
31
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11
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26
15
10
48
1.77
5379549--5379681
57
2.2
57
80
7
149
25
15
12
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1.79
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20
2.7
20
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0
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12
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35
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1.89
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48
21
0
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1.50
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18
1.98
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1.9
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0
2
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2
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0
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15
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0
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0
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2.3
23
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1
0
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1.03
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7.6
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0
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1.9
83
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0
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3.0
21
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0
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15
1.89
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182
2.0
182
95
1
652
28
14
21
35
1.92
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25
5.0
24
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25
21
22
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1.98
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20
3.3
20
93
0
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32
20
11
34
1.90
5403705--5403760
11
5.5
11
71
16
57
32
19
12
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5414202--5414243
2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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2.4
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118
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3
0
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1.19
5415762--5415841
18
4.6
17
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20
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52
3
0
43
1.19
5415777--5415840
12
5.3
12
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51
3
0
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1.17
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234
2.1
239
81
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585
47
7
9
36
1.63
5415829--5416282
244
1.9
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2
100
0
86
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345