Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  58  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16213139--16213172
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20
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23
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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127
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18
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1
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15
2.3
15
95
0
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5
5
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1.50
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2.4
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20.5
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25
33
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1.56
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1.9
21
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53
25
20
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1.70
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11.0
7
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1
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2.4
18
88
0
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18
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45
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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129
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2.0
259
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2
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4
4
56
1.39
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273
3.0
272
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21
21
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123
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416
27
16
16
39
1.90
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0
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18
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0
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27
1.98
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32
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1.96
16350138--16351169
256
4.1
259
88
6
1567
28
17
31
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16352679--16352716
19
2.0
19
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0
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31
23
10
34
1.89
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5.5
89
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3
518
31
20
25
23
1.98
16357798--16358281
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177
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555
31
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25
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24
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26
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23
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83
34
0
0
65
0.93
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131
2.6
130
87
2
463
27
16
20
35
1.94
16361923--16362006
21
3.9
22
73
18
70
73
0
8
17
1.07
16361925--16362009
23
3.7
22
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13
75
74
0
8
17
1.06
16362066--16362103
6
6.2
6
82
17
51
78
2
0
18
0.86
16362066--16362103
13
3.1
12
82
17
51
78
2
0
18
0.86
16363331--16363390
16
3.7
18
75
20
60
55
5
0
40
1.22
16364595--16364673
33
2.4
32
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30
7
5
56
1.49
16367073--16367120
3
16.0
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100
0
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0
0
66
0.92
16367324--16367380
3
18.7
3
92
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29
0
1
68
1.00
16371323--16371361
19
2.1
18
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10
35
1.89
16374580--16374616
16
2.3
16
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0
1.30
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23
20
1.97
16379496--16379914
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43
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212
34
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22
20
1.96
16379547--16379958
44
9.5
44
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5
262
34
22
23
19
1.96
16379407--16380042
174
3.7
174
86
2
818
34
22
23
20
1.97
16379407--16380042
261
2.4
259
86
3
882
34
22
23
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16382583--16382666
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3.2
26
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0
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1.77
16385799--16385836
9
4.1
9
90
6
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55
2
0
42
1.14
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20
2.2
20
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8
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53
8
0
37
1.32
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21
2.0
20
90
10
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5
2
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27
2.3
26
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3
33
1.29
16386129--16386200
27
2.8
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34
1.32
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2.0
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80
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2
30
1.20
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19
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2.1
20
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59
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19
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2.3
24
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26
2.5
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30
0
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1.02
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1.48
16392329--16392422
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1.9
49
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154
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1.22
16392492--16392550
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2.1
28
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37
0
0
62
0.95
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0
63
64
0
0
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2.9
24
75
12
72
62
1
0
35
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16400178--16400228
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2.8
18
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1
0
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1.10
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0
0
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0.95
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17
2.4
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12
50
36
0
4
58
1.20
16403978--16404008
2
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2
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0
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0
0
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1.00
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3
16
1.08
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2.8
25
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0
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24
25
25
2.00
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2.8
27
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22
21
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1.97
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26
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1.83
16411398--16411596
54
3.6
54
77
5
202
30
9
19
40
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345