Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  33  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10074790--10075007
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2.3
92
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3
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0
0
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1.98
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2.6
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4
140
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25
24
18
1.97
10093065--10093305
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1.95
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7
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21
1.95
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1.94
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30
20
19
1.97
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130
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18
21
1.97
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1.66
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21
29
27
1.98
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46
3.8
46
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12
216
20
21
29
28
1.98
10112440--10112611
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
10114573--10114745
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1.9
93
92
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21
20
1.98
10114566--10114741
46
3.8
46
78
10
196
28
30
21
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10114617--10114760
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29
20
20
1.97
10117043--10117171
44
2.8
45
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13
24
27
1.93
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44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
10132873--10132917
21
2.2
20
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4
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22
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10132880--10132941
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20
8
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2.0
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20
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21
23
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2
2
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25
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1.57
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2.3
27
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6
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10147293--10147352
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23
6
10
60
1.52
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2.0
24
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2.2
80
83
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224
24
27
22
25
2.00
10151288--10151472
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4.6
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222
25
27
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100
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0
0
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2.2
41
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5
123
34
1
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56
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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11
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35
1
0
62
1.06
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20
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0
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1.12
Indices
Period
Size
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Number
Consensus
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Indels
Score
A
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(0-2)
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27
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10291154--10291389
81
2.9
79
71
13
194
33
19
10
36
1.86
10291345--10291514
27
6.3
26
75
11
121
38
21
11
29
1.88
10291352--10291507
54
2.9
54
81
5
147
40
19
10
29
1.85
10291385--10291524
27
5.2
26
79
8
147
42
20
7
30
1.80
10291385--10291534
54
2.8
53
80
6
169
42
20
8
29
1.80
10291501--10291590
27
3.3
27
77
14
94
44
15
7
32
1.75
10291513--10291598
27
3.1
27
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14
95
40
12
9
37
1.76
10292958--10293014
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
10292956--10293026
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
10292967--10293021
11
5.4
11
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16
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36
12
20
30
1.90
10293072--10293176
23
4.4
24
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7
160
30
20
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26
1.98
10293073--10293165
48
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48
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4
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22
21
27
1.99
10293353--10293416
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2.1
31
90
0
101
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23
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22
3.0
22
80
0
80
44
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20
16
1.86
10298293--10298327
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
10307861--10307888
11
2.5
11
100
0
56
82
0
0
17
0.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10312186--10312313
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2.3
56
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0
229
28
14
10
45
1.79
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24
2.0
24
83
8
60
46
4
19
29
1.68
10320928--10321009
21
3.7
21
67
15
58
56
3
4
35
1.39
10320917--10321015
44
2.4
39
75
17
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5
4
33
1.39
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8
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0
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0
0
75
0.81
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87
7
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19
18
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1.95
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21
3.7
21
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15
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3
4
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1.39
10335763--10335861
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33
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1.9
20
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21
1.70
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19
2.1
19
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42
2
2
52
1.29
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17
2.1
17
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72
0
0
27
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19
2.2
20
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12
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48
6
4
39
1.51
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20
2.2
19
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4
57
38
7
2
52
1.42
10339217--10339259
19
2.3
19
80
8
52
39
6
2
51
1.42
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10
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20
4
0
74
1.00
10345373--10345414
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19
100
0
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19
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2.0
28
100
0
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21
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2.0
14
100
0
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21
21
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2.1
17
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0
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45
1.26
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3
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3
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0
30
0
0.88
10353085--10353160
16
5.0
15
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71
0
28
0
0.87
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27
2.5
28
83
11
79
70
0
29
0
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10353085--10353166
30
2.8
31
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15
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0
31
0
0.90
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3.7
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63
0
34
1
1.05
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30
1.9
31
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93
67
3
5
23
1.26
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133
1.9
133
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4
311
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7
7
27
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8
29
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7
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0
2
22
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137
97
0
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19
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31
1.98
10362540--10362699
26
6.2
26
94
2
261
33
4
24
38
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345