Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  96  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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2.0
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
6
69
1.12
26225006--26225064
26
2.4
24
83
10
75
28
0
3
67
1.06
26226239--26226360
60
2.0
60
98
0
235
32
9
13
44
1.76
26229696--26229794
40
2.5
40
89
0
144
24
16
24
35
1.95
26232053--26232091
20
2.1
18
85
9
51
61
0
2
35
1.10
26232055--26232120
27
2.5
26
76
11
71
68
0
4
27
1.09
26232095--26232147
11
5.1
10
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17
54
75
1
9
13
1.12
26247540--26247587
14
3.5
13
75
10
51
33
8
2
56
1.41
26250955--26251012
25
2.3
25
78
0
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41
20
18
18
1.91
26253031--26253142
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30
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11
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0
7
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1.36
26253031--26253128
31
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31
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0
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0
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1.47
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2.1
22
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7
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17
0
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46
1.48
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126
2.8
126
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0
579
35
18
20
26
1.95
26258046--26258088
18
2.4
18
92
0
68
41
9
27
20
1.83
26258270--26258322
24
2.2
24
93
6
90
26
22
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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0
50
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16
0
28
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7
3.7
7
100
0
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15
0
26
1.38
26258694--26258739
14
3.3
14
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11
60
56
15
0
28
1.39
26260002--26260058
11
5.3
11
75
12
55
43
1
17
36
1.60
26260001--26260058
21
2.7
21
76
12
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44
1
17
36
1.59
26271749--26271841
45
2.0
46
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2
152
27
20
15
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1.92
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20
2.0
20
100
0
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1.95
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39
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19
1.98
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0
0
50
1.00
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235
24
21
27
26
1.99
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2.3
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82
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232
24
22
27
26
2.00
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24
21
27
26
1.99
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15
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15
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17
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32
4
1
61
1.23
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13
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32
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2
62
1.23
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48
2.8
47
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31
3
2
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1.27
26287738--26287830
26
3.5
25
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73
32
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1.22
26287743--26287841
17
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17
77
14
77
33
1
5
60
1.25
26287790--26287897
31
3.4
32
78
11
114
45
0
4
50
1.22
26293542--26293602
24
2.5
24
85
12
81
55
3
3
37
1.32
26295043--26295153
37
3.0
37
100
0
222
45
13
13
27
1.81
26295172--26295304
70
1.9
70
89
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209
36
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10
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26298121--26298201
6
13.5
6
92
0
108
20
34
24
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26303457--26303489
16
2.1
16
94
0
57
75
6
15
3
1.11
26304454--26304543
23
3.9
23
86
2
101
11
3
35
50
1.55
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23
2.0
23
82
8
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40
13
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37
1.76
26307274--26307315
11
3.9
11
85
14
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47
4
0
47
1.23
26307274--26307322
22
2.2
23
96
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91
44
4
0
51
1.20
26307274--26307322
11
4.4
11
82
17
57
44
4
0
51
1.20
26308301--26308332
16
2.0
16
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0
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50
3
12
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1.9
25
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32
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3.3
19
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23
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31
10
21
36
1.87
26318794--26318861
33
2.1
33
100
0
136
33
11
20
33
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345