Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
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This is table  60  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16675182--16675218
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9
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0
0
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0
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0
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2.8
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214
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27
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0
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2
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4
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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55
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3.0
23
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16704887--16704926
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2
2
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1.22
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64
1.20
16705112--16705185
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0
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0
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30
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3.4
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20
21
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1.98
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2.1
80
80
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20
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1.96
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2.6
39
85
0
139
12
25
22
38
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.54
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1.60
16769321--16769360
21
1.9
22
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10
57
22
0
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57
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13
59
24
0
23
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1.54
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16
0
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0
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45
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18
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125
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1
8
34
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16795778--16795817
19
2.1
19
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25
0
3
70
1.02
16796020--16796071
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0
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0
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0
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23
0
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2.0
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10
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74
1
0
24
0.92
16797280--16797321
6
7.0
6
100
0
84
50
16
0
33
1.46
16801047--16801092
22
2.0
24
87
8
69
34
0
0
65
0.93
16803039--16803090
18
2.7
19
79
8
61
61
0
1
36
1.07
16811796--16811843
24
2.0
24
100
0
96
37
20
12
29
1.90
16813278--16813308
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
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2
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2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
16814356--16814387
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
16821722--16821750
9
3.2
9
100
0
58
24
10
20
44
1.82
16827860--16827904
5
9.0
5
97
0
72
24
0
40
35
1.56
16828165--16828207
20
2.2
20
87
8
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39
4
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48
1.51
16828587--16828652
15
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15
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43
0
3
53
1.16
16828671--16828707
16
2.3
16
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13
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40
0
0
59
0.97
16828719--16828774
22
2.6
22
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5
62
51
0
0
48
1.00
16836299--16836381
30
2.8
28
72
16
78
65
0
7
27
1.19
16838182--16838216
17
2.1
17
100
0
70
17
28
5
48
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16841708--16842294
311
1.9
310
81
6
704
37
13
15
33
1.86
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43
2.4
43
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4
131
32
25
16
25
1.96
16846054--16846232
89
2.0
90
84
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238
37
11
23
26
1.89
16847787--16847830
6
7.2
6
79
5
52
45
13
20
20
1.85
16847808--16847920
45
2.5
45
83
0
145
42
15
17
23
1.88
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20
2.2
19
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12
59
57
4
0
38
1.20
16851076--16851159
12
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12
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23
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42
3
2
51
1.32
16851121--16851159
11
3.5
11
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60
46
0
0
53
1.00
16851121--16851159
6
6.8
6
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11
55
46
0
0
53
1.00
16855134--16855159
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2.2
12
100
0
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80
0
0
19
0.71
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2.4
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100
0
68
17
8
14
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1.61
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6
5.2
6
100
0
62
35
32
16
16
1.91
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28
2.0
28
96
0
105
42
12
17
28
1.85
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3
18.3
3
96
0
101
65
0
1
32
1.03
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2.1
24
96
0
91
18
16
16
50
1.79
16890114--16890168
12
4.7
12
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2
58
30
3
5
60
1.37
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3
13.7
3
89
0
64
31
2
2
63
1.20
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19
2.2
19
100
0
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43
21
4
29
1.73
16902254--16902352
44
2.2
46
85
8
134
31
17
19
32
1.94
16902254--16902367
44
2.6
44
83
9
126
31
17
18
32
1.94
16902254--16902434
45
4.1
44
79
10
145
37
15
16
30
1.89
16903286--16903325
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16904063--16904101
12
3.2
12
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13
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23
2
0
74
0.94
16904161--16904211
3
17.3
3
79
4
59
29
3
3
62
1.31
16904178--16904215
12
3.4
11
86
13
51
31
2
2
63
1.22
16908102--16908284
79
2.3
81
85
7
241
25
27
22
24
2.00
16908081--16908284
40
5.1
40
83
8
247
25
27
22
24
1.99
16924295--16924519
40
5.7
40
84
5
262
26
26
20
25
1.99
16924295--16924519
79
2.8
79
84
7
278
26
26
20
25
1.99
16932077--16932308
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2.9
77
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261
26
26
20
26
1.99
16932084--16932308
40
5.7
40
83
6
262
27
26
20
25
1.99
16941155--16941214
11
5.5
11
73
13
52
70
0
6
23
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345