Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  328  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Score
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1.93
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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(0-2)
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86
76
8
296
34
22
22
20
1.96
98409203--98409540
130
2.6
129
84
2
446
35
22
21
20
1.96
98409248--98409712
217
2.1
216
87
1
655
34
21
22
20
1.96
98409463--98409707
130
1.9
130
87
1
366
35
21
21
21
1.96
98411520--98411572
12
4.2
12
77
20
54
30
1
1
66
1.13
98411536--98411602
3
21.3
3
79
14
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29
7
1
61
1.32
98411529--98411594
24
2.8
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13
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30
7
1
60
1.33
98411616--98411655
20
2.0
21
85
5
55
27
15
2
55
1.53
98411536--98411663
12
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12
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10
2
58
1.44
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24
2.0
23
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8
0
54
1.31
98411729--98411767
12
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2.0
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20
2.7
18
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51
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2
42
1.32
98420284--98420431
68
2.1
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160
52
5
3
39
1.41
98422359--98422500
27
5.2
27
82
5
153
33
21
24
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98422359--98422500
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2.6
54
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3
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33
21
24
19
1.97
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8
3.8
8
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0
51
3
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26
43
1.70
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2.0
20
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0
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10
1.78
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47
2.8
48
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2
203
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28
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24
1.96
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1.9
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30
1.96
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0
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18
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1.94
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1.57
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39
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1.57
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0
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28
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24
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20
2.0
20
89
0
60
25
12
0
61
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98457967--98458026
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2.9
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55
5
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36
1.38
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0
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1.37
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2.0
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0
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0
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0
0
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2.4
33
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12
88
25
25
17
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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