Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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This is table  80  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21999154--21999324
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0
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28
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21999149--21999321
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46
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25
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377
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0
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2.2
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22
2.1
22
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7
60
61
6
2
29
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.45
22023155--22023199
21
2.1
21
87
0
63
53
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1.52
22023150--22023200
21
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100
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21
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2
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34
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0
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28
0
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2
4
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1
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22053903--22053932
14
2.1
14
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0
51
70
0
0
30
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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21
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22
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16
19
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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71
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16
21
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1.95
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16
17
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17
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18
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4.2
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2
177
36
24
4
34
1.76
22111296--22111340
23
2.0
23
90
0
72
31
0
6
62
1.21
22111378--22111452
30
2.5
30
81
10
82
34
2
6
56
1.40
22111424--22111481
24
2.3
26
83
13
70
32
3
6
56
1.42
22111538--22111574
19
1.9
19
94
0
65
32
13
2
51
1.55
22112258--22112365
26
4.2
26
92
0
171
34
6
23
36
1.80
22113960--22114100
27
5.2
26
81
10
167
17
22
23
36
1.95
22113957--22114100
54
2.7
54
92
4
229
17
22
23
36
1.95
22113957--22114118
54
3.0
52
87
7
211
19
23
21
35
1.96
22113960--22114118
81
2.0
79
80
10
180
19
23
21
35
1.96
22115035--22115076
22
2.0
22
90
4
68
28
11
0
59
1.33
22115184--22115239
25
2.3
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37
16
3
42
1.65
22117442--22117532
45
2.0
45
93
0
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51
2.1
51
92
0
180
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5
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36
1.79
22118301--22118408
26
4.2
26
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3
175
34
5
24
36
1.79
22124068--22124199
26
5.2
25
95
4
205
34
4
25
36
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22124068--22124199
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2.6
50
91
4
203
34
4
25
36
1.76
22128459--22128499
21
2.0
21
95
0
73
24
17
29
29
1.97
22129755--22129795
21
2.0
21
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0
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31
24
17
26
1.97
22131886--22131931
24
1.9
24
86
0
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1.51
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21
2.5
21
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0
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1.96
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21
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82
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1.94
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0
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0
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1.28
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15
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10
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15
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1.9
186
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1.91
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538
31
19
15
34
1.92
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44
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1.86
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93
90
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5.1
9
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0
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32
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1.69
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17
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0
70
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5
0
17
0.96
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20.3
3
100
0
122
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0
0
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22
2.5
23
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30
1
5
61
1.29
22150404--22150457
25
2.2
25
83
12
67
31
1
5
61
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22150585--22150682
3
32.7
3
79
11
103
32
6
1
60
1.28
22150645--22150734
26
3.5
25
76
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26
10
2
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1.40
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2
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100
0
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0
0
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2.0
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220
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23
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20
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0
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1.9
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14
88
55
0
4
39
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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