Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  304  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91598410--91598638
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2.0
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0
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38
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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10
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20
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29
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2.0
25
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0
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36
18
20
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91811366--91811411
19
2.4
19
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39
0
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54
1.26
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2.0
266
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11
100
44
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1
53
1.19
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46
3.8
46
76
12
189
21
21
28
28
1.99
91835216--91835388
93
1.9
93
92
0
292
21
21
28
27
1.99
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16
2.1
16
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10
52
64
0
0
35
0.94
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21
2.4
21
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50
25
17
9
47
1.78
91840460--91840554
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2.3
42
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5
104
14
20
17
47
1.83
91842434--91842476
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2.0
23
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9
63
51
0
2
46
1.13
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2.1
44
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0
128
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9
5
47
1.60
91842922--91842958
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
91843279--91843325
21
2.3
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6
8
27
1.53
91843830--91843905
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21
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18
10
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91845867--91845895
14
2.0
15
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0
6
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128
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18
30
1.95
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13
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2.0
66
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1
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2.3
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3
156
26
16
37
19
1.92
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11
3.0
11
90
0
57
24
0
0
75
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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147
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8
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25
5
8
60
1.48
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16
2.1
17
88
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20
2
2
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1.09
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18
3.5
17
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39
8
0
52
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37
2.2
37
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4
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0
3
32
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15
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0
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1.92
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2.4
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0
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1.94
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1
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1.86
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1.94
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1.9
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1.83
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14
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35
1
15
48
1.53
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30
4.6
30
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11
189
35
2
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48
1.55
91876080--91876225
64
2.3
64
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1
229
34
1
14
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1.52
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2.0
38
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53
2
5
38
1.37
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3.7
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99
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91876232--91876704
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2.3
207
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1.46
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2.0
34
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0
127
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1.87
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25
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2.7
49
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0
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31
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2.1
32
100
0
136
26
11
29
32
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2.0
81
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0
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29
9
30
30
1.89
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47
4.4
47
90
1
281
31
7
31
29
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91884763--91884862
29
3.2
29
73
23
105
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6
8
34
1.55
91885067--91885109
7
6.1
7
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10
52
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4
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1.69
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24
2.0
24
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0
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0
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20
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29
28
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1.8
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0
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3.8
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216
20
21
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1.98
91897008--91897179
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1.8
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0
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20
21
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0
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0
0
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0
64
50
50
0
0
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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