Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  320  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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13
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22
2.1
23
92
3
80
41
16
8
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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51
2
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1.47
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90
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7
406
29
9
10
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1.69
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2.0
40
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135
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7
13
35
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2.4
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20
18
16
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0
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20
0
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20
2.5
20
83
3
57
21
21
15
41
1.90
96065221--96065252
5
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5
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57
81
0
0
18
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96065222--96065252
9
3.3
9
95
4
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80
0
0
19
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96069671--96069702
5
6.6
5
92
7
57
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0
0
18
0.70
96069672--96069702
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
96076024--96076056
17
1.9
17
100
0
66
48
6
12
33
1.65
96076018--96076056
17
2.4
16
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12
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51
7
10
30
1.64
96078902--96078928
6
4.5
6
100
0
54
0
85
0
14
0.61
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480
3.0
480
98
0
2810
46
17
12
24
1.82
96081870--96081907
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2.5
15
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8
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71
5
13
10
1.30
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2
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0
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1
18
1.33
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437
2.0
437
98
0
1674
39
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1.79
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36
2.0
36
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0
146
27
2
19
50
1.61
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52
2.0
50
90
3
163
38
14
12
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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54
2
2
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1.24
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24
2.4
25
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50
0
1
47
1.11
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387
2.0
387
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0
1390
38
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15
29
1.90
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26
4.2
26
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2
150
35
24
3
36
1.73
96119678--96119788
53
2.1
52
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35
24
3
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1.73
96121814--96121847
17
2.1
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50
35
11
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1.83
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20
21
20
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1.9
23
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40
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29
22
1.80
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24
25
26
23
2.00
96136775--96136917
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2.0
71
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25
25
24
2.00
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3.1
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26
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24
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2.0
43
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0
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1.88
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18
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1.91
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2.0
40
100
0
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0
0
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23
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2.4
14
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10
50
45
6
0
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0
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0
0
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19
2.2
20
92
4
72
27
11
11
50
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96164341--96164379
21
1.9
20
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33
20
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33
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96164411--96164455
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7.3
6
85
5
63
37
2
57
2
1.23
96164411--96164461
24
2.1
24
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100
0
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29
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84
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19
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3.1
22
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73
14
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96168403--96168583
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4.2
42
82
2
191
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20
2.0
20
84
0
51
23
33
0
43
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345