Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  242  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71192930--71192996
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5
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70
0
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1.13
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9
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2.1
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0
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27
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2.3
21
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22
14
12
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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22
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0
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15
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2.8
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2.9
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2.3
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258
24
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1.95
71272988--71273168
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213
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2.0
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95
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2.3
31
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7
104
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14
27
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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2
5
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1.75
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2.0
22
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12
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0
20
9
70
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71310620--71310674
26
2.1
26
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0
20
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72
1.07
71316191--71316242
25
2.1
25
85
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30
32
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28
1.85
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28
21
24
1.99
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0
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71
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5
14
1.29
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27
2.2
26
88
8
84
30
10
18
40
1.84
71329792--71329903
55
2.0
55
98
0
215
35
10
17
35
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71330946--71330970
9
2.8
9
100
0
50
40
0
12
48
1.40
71331222--71331256
17
2.0
18
88
5
54
37
5
14
42
1.69
71331323--71331384
24
2.6
24
84
5
90
29
11
27
32
1.91
71332921--71332968
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
71336622--71336744
46
2.7
46
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1
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21
20
28
30
1.98
71344058--71344227
93
1.8
92
92
1
286
21
21
28
27
1.99
71344062--71344232
46
3.7
46
78
13
197
22
21
28
28
1.99
71349685--71349731
19
2.5
19
90
10
78
8
4
4
82
0.91
71349685--71349732
20
2.5
20
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3
80
8
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4
83
0.90
71350102--71350148
14
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14
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5
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44
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29
19
1.75
71352029--71352053
13
1.9
13
100
0
50
56
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1.47
71353844--71353883
19
2.1
19
85
0
53
25
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22
1.95
71355655--71355704
18
2.8
18
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0
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14
28
0
58
1.37
71356373--71356405
12
2.8
12
95
0
57
0
24
18
57
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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10
0
27
1.28
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30
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30
73
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88
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16
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26
1.97
71366750--71366831
30
2.7
30
70
7
85
28
28
17
26
1.97
71376890--71377021
50
2.6
51
82
3
167
37
13
14
34
1.86
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17
2.9
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17
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14
36
1.90
71382189--71382251
18
3.5
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65
1
19
14
1.35
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1.96
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27
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29
1.95
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1
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1.00
71390012--71390068
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5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
71390012--71390068
16
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17
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1
17
3
1.00
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0
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12
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1.77
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12
2.1
12
100
0
50
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0
16
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1.02
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2.6
18
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0
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30
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0
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43
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14
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14
85
0
60
43
6
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18
1.75
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71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
71416026--71416223
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
71418597--71418631
17
2.0
18
88
5
54
71
8
8
11
1.31
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29
2.5
29
93
6
125
53
18
1
26
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71424165--71424234
27
2.5
28
95
2
124
30
12
25
31
1.93
71424165--71424246
27
3.0
27
87
5
76
30
14
23
31
1.94
71434972--71435031
25
2.3
26
81
13
70
60
1
3
35
1.23
71443116--71443304
48
4.0
48
87
6
257
26
13
28
31
1.94
71443212--71443319
42
2.6
42
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2
173
30
12
26
29
1.93
71443212--71443336
42
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42
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2
126
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1.93
71448466--71448701
27
8.7
27
93
0
375
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34
1.89
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17
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1.91
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0
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33
1.90
71452305--71452512
54
3.9
54
90
0
308
35
14
16
33
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345