Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  345  ( 41379 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1535345--1535517
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0
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2.7
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1.9
31
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0
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2.0
21
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1.9
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42
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1.95
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2.5
28
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29
13
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1.95
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28
3.5
28
86
6
114
28
13
27
29
1.95
1615901--1615972
29
2.5
28
91
6
110
29
13
27
29
1.95
1617447--1617626
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5.8
31
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2
274
25
27
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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12
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2.4
23
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1642460--1642528
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2.2
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0
0
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2.0
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2.0
18
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5
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37
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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0
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23
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1805665--1805726
31
2.0
31
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6
81
40
6
4
48
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1810922--1810960
15
2.6
15
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20
0
10
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0
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17
0
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0
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21
2.6
21
77
8
58
29
7
3
60
1.41
1834931--1835001
29
2.4
31
83
4
83
29
4
15
50
1.63
1845673--1845733
32
1.9
33
83
9
83
29
14
18
37
1.90
1850743--1850805
34
1.9
31
87
9
90
31
3
4
60
1.33
1852371--1852413
21
2.0
21
86
8
61
58
0
0
41
0.98
1853042--1853108
29
2.3
28
84
7
80
34
11
2
50
1.54
1854223--1854259
2
19.0
2
88
5
58
45
0
2
51
1.15
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2
14.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
1857037--1857099
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3.1
22
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4
25
1.47
1857025--1857099
38
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1.50
1857046--1857084
16
2.4
16
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4
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58
10
5
25
1.51
1860086--1860128
21
2.0
21
100
0
86
34
13
13
37
1.85
1862069--1862127
30
2.0
29
90
3
91
44
1
3
50
1.28
1864089--1864135
20
2.5
20
72
6
53
74
6
0
19
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1865686--1865761
37
2.1
36
80
17
88
55
2
0
42
1.14
1876723--1876752
16
1.9
15
93
6
51
0
10
43
46
1.37
1881756--1881821
28
2.3
30
80
17
77
40
0
3
56
1.15
1881786--1881830
24
2.0
23
87
12
67
48
0
0
51
1.00
1881760--1881830
27
2.8
26
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14
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43
0
2
53
1.15
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19
2.0
19
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10
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0
2
68
1.03
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3.0
30
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0
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47
3
21
1.67
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4.3
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27
46
3
21
1.69
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25
5.0
25
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10
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4
2
57
1.31
1891222--1891280
25
2.4
25
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0
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3
0
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1.13
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25
2.5
24
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10
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33
8
6
50
1.59
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25
2.0
25
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0
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34
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6
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1.57
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16
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15
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6
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2
2
64
1.16
1891519--1891570
8
6.5
8
82
8
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30
1
1
65
1.14
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2.5
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0
1
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2.0
25
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68
5
0
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13
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0
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0
0
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1.00
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2.0
26
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77
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1
1
56
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1909357--1909399
15
2.9
15
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0
50
20
2
2
74
1.04
1911971--1912008
18
2.2
18
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4
51
36
0
2
60
1.11
1919374--1919398
12
2.1
12
100
0
50
52
8
0
40
1.31
1922541--1922573
16
2.1
16
100
0
66
18
33
30
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1923166--1923328
79
2.0
80
91
1
265
33
31
10
24
1.89
1925963--1925992
6
5.0
6
95
0
51
13
53
0
33
1.40
1926752--1926814
19
3.5
19
78
6
69
65
1
0
33
1.03
1926783--1926842
19
3.0
20
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14
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3
0
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2.8
19
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1
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40
1.28
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100
0
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0
0
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2
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2
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0
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0
0
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0
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1.16
1938877--1939002
43
2.9
42
72
8
119
20
23
21
34
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345