Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  340  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101438392--101438474
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1
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2.6
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1.00
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0.87
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2.1
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2.2
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17
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2.2
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64
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56
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26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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25
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2.0
46
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2.00
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2.2
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0
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20
26
27
1.99
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19
2.3
20
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58
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4
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1.22
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2.1
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0
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33
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32
2
0
64
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1.9
42
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9
103
40
0
4
54
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101610659--101610694
5
7.8
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17
51
41
0
0
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2.0
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0
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0.96
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0
0
60
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0
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3.3
18
66
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33
7
16
42
1.75
101616423--101616567
42
3.4
43
76
10
147
30
22
16
31
1.96
101619121--101619228
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
101624869--101624976
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
101626450--101626502
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
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101626693--101626744
17
2.7
19
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20
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15
5
48
30
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101626706--101626744
17
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18
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15
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48
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1.66
101626706--101626751
17
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17
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3
65
15
4
50
30
1.63
101628068--101628106
20
2.0
20
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0
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101628264--101628368
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22
24
1.97
101631582--101631673
35
2.8
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4
7
33
1.49
101631999--101632039
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0
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1.9
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2
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19
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1.95
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101666495--101666563
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2.8
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1.93
101668704--101668843
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2.3
60
84
8
178
26
25
20
27
1.99
101668703--101668804
28
3.5
27
71
19
80
24
28
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
54
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26
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5.0
6
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0
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16
30
1.91
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2
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2
95
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0
0
50
1.00
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11
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0
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0
0
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0
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1
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1.13
101685970--101686023
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0
0
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0
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0
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1.00
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0
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0
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1.50
101690609--101690680
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2.3
30
80
7
90
12
5
18
63
1.47
101690612--101690647
14
2.5
15
95
4
65
16
5
13
63
1.47
101690611--101690683
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101690611--101690678
15
4.5
15
72
24
63
13
5
19
61
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101692057--101692202
48
2.9
50
79
13
174
34
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16
28
1.94
101692244--101692917
140
4.8
135
91
6
940
31
20
15
32
1.94
101692358--101692917
70
7.9
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94
2
715
31
20
15
32
1.94
101692259--101692917
217
3.1
217
97
1
1224
31
20
15
32
1.94
101701548--101701719
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1.8
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96
0
317
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22
20
1.98
101701540--101701715
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3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98
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29
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1.63
101704107--101704183
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1.68
101707134--101707305
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345