Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  21  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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101
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340
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2.2
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2.0
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20
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3
57
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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18
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18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
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96
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317
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29
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1.98
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46
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12
216
28
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1.98
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26
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20
15
24
1.91
7195210--7195235
6
4.3
6
100
0
52
0
15
0
84
0.62
7195832--7195878
25
1.9
25
86
4
69
61
17
8
12
1.55
7203217--7203274
25
2.3
25
85
5
73
37
6
0
55
1.27
7203230--7203283
25
2.1
26
82
3
65
33
11
0
55
1.35
7207648--7207682
4
8.8
4
100
0
70
0
48
25
25
1.51
7211971--7211998
2
14.0
2
100
0
56
50
0
50
0
1.00
7222134--7222195
15
4.1
15
91
6
81
69
0
30
0
0.89
7235112--7235147
13
2.6
14
86
8
56
11
41
16
30
1.83
7236816--7236926
55
2.0
55
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0
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49
7
18
25
1.72
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64
2.0
64
100
0
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3
48
1.59
7246122--7246240
60
2.0
61
80
5
134
42
11
5
40
1.66
7248663--7248691
14
2.0
15
93
6
51
75
0
13
10
1.04
7248784--7248829
18
2.5
19
80
13
53
34
2
4
58
1.30
7248763--7248789
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7249869--7249949
38
2.1
38
100
0
162
46
7
14
30
1.72
7255004--7255046
17
2.5
17
88
7
61
74
2
0
23
0.93
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30
1.9
30
82
13
73
15
24
29
29
1.96
7257529--7257560
2
16.0
2
93
0
55
50
3
0
46
1.17
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24
1.9
24
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0
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21
23
4
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1.67
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16
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16
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0
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44
0
10
1.38
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26
2.0
27
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29
7
3
59
1.42
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23
2.0
22
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0
2
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1.09
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2.1
22
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60
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0
6
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1.24
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19
5.7
19
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32
4
0
61
1.22
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9
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7
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32
0
0
67
0.91
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29
2.5
30
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12
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64
5
2
27
1.27
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16
1.9
16
100
0
62
0
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0
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18
2.5
20
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13
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36
10
0
53
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53
2.0
53
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10
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1.70
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22
2.00
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23
23
27
24
2.00
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38
2.7
40
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15
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25
25
27
20
1.99
7325342--7325491
40
3.8
40
75
15
132
26
24
27
22
2.00
7325379--7325507
40
3.2
40
79
3
145
24
23
27
24
2.00
7332545--7332687
40
3.6
38
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11
137
27
25
27
19
1.99
7332585--7332710
40
3.2
40
80
2
137
24
24
28
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7335382--7335408
2
13.5
2
100
0
54
48
0
51
0
1.00
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2.3
11
100
0
50
40
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1.77
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2
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2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
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4
4
32
1.41
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39
2.6
39
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4
103
53
4
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2.3
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2
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7.7
72
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19
16
30
1.94
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240
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213
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17
730
34
19
16
30
1.94
7360979--7362417
162
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144
72
16
835
34
19
16
30
1.94
7361466--7361724
91
2.9
91
77
12
266
37
17
17
27
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345