Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  112  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30145352--30145493
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10
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1.50
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3.1
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152
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18
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15
73
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9
25
5
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.1
48
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1.9
26
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0
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8
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68
1.24
30241246--30241320
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7.1
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6
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0
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2.0
21
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9
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0
23
30
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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11
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1.89
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13
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22
11
33
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21
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1.86
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13
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1.92
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354
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1200
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1.93
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1.9
139
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1.55
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589
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17
20
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30290330--30290494
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1.9
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19
19
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1.96
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54.7
3
67
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2
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2.0
23
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0
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0
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2.0
20
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2
7
52
1.43
30292565--30292627
21
3.0
21
81
6
67
34
4
4
55
1.42
30292629--30292665
16
2.2
17
90
4
58
24
0
24
51
1.49
30295716--30295744
12
2.5
12
94
5
51
65
3
0
31
1.09
30295813--30296035
122
1.8
119
80
6
261
37
15
13
34
1.86
30299782--30299865
40
2.1
40
82
4
98
25
1
4
69
1.15
30311374--30311413
18
2.4
17
84
15
57
35
0
5
60
1.19
30312998--30313037
20
2.0
20
100
0
80
55
0
0
45
0.99
30313089--30313122
17
2.0
17
88
0
50
61
2
5
29
1.34
30319850--30320080
118
2.0
118
88
0
345
29
22
17
29
1.97
30319971--30320215
44
5.5
44
77
10
241
30
22
18
28
1.97
30319971--30320217
89
2.8
88
76
9
252
29
22
18
29
1.97
30319960--30320214
133
1.9
133
95
0
456
29
23
17
29
1.97
30332006--30332123
3
39.7
3
83
1
148
63
1
4
30
1.23
30333800--30333838
18
2.1
19
95
4
71
12
0
10
76
1.01
30338230--30338270
16
2.4
17
88
8
57
41
0
2
56
1.13
30338347--30338441
44
2.2
42
80
12
97
30
4
3
62
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30338450--30338482
15
2.3
15
89
5
50
15
0
9
75
1.03
30350407--30350800
119
3.3
119
97
0
743
33
17
19
29
1.95
30350815--30350968
83
1.9
83
91
0
254
35
20
16
26
1.94
30352619--30352659
16
2.4
17
88
8
57
41
0
2
56
1.13
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15
2.3
15
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5
50
15
0
9
75
1.03
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15
2.7
15
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0
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34
0
2
63
1.08
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14
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13
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9
54
22
9
0
68
1.18
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2.3
11
100
0
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0
0
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0.86
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2.5
20
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34
0
2
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1.06
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2.9
22
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4
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33
20
23
22
1.97
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57
2.0
57
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0
219
35
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26
1.95
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4.0
52
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181
30
29
16
23
1.96
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3
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3
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13
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31
5
5
56
1.46
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18
4.1
18
75
7
67
30
6
4
58
1.43
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28
2.6
29
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12
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35
2
6
54
1.41
30371374--30371442
26
2.7
25
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12
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2
7
55
1.43
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9
5.8
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15
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36
8
19
35
1.83
30385589--30385659
20
3.7
20
90
7
103
38
9
18
33
1.84
30385608--30385646
11
3.7
11
80
13
55
35
10
20
33
1.86
30385713--30385848
52
2.7
51
94
5
233
27
22
23
26
1.99
30385713--30385848
26
5.3
26
89
3
199
27
22
23
26
1.99
30386856--30387240
73
5.3
73
89
1
562
25
16
21
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30387223--30387257
17
2.1
17
88
0
52
17
8
2
71
1.23
30389203--30389323
3
39.0
3
70
15
59
30
5
5
57
1.46
30389733--30389819
28
3.2
27
78
12
81
35
4
5
54
1.45
30389749--30389817
26
2.7
25
76
12
68
34
2
7
55
1.43
30389863--30389894
2
16.0
2
93
0
55
46
0
3
50
1.17
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22
2.1
22
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7
69
21
0
0
78
0.75
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4
8.5
4
100
0
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0
0
50
1.00
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0
0
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0.83
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18.4
5
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14
54
20
1
4
74
1.05
30392152--30392215
12
5.7
11
80
15
60
20
1
3
75
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345