Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  345  ( 41379 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8425299--8425342
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177
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22
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2.0
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192
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24
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1.89
8454537--8454707
74
2.4
73
83
9
217
33
23
10
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1.89
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35
3.1
34
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14
119
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26
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8457449--8457478
13
2.4
13
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5
53
16
6
3
73
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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129
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2
568
32
15
18
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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58
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8570855--8570909
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2.3
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18
82
13
55
66
0
33
0
0.92
8580279--8580386
51
2.1
53
84
8
141
17
17
22
42
1.89
8580513--8580586
18
4.1
18
74
6
69
33
13
14
37
1.86
8582533--8582585
21
2.5
20
85
8
70
41
15
11
32
1.82
8586855--8586909
6
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6
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0
110
49
16
0
34
1.46
8587408--8587437
14
2.2
13
94
5
51
73
0
13
13
1.10
8588695--8588738
15
2.9
15
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10
54
43
2
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47
1.42
8588695--8588751
15
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15
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43
1
7
47
1.40
8589244--8589324
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0
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19
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19
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0
24
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1.53
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2
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2
78
0
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10
0
38
1.36
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6
8.5
6
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8
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0
36
1.40
8590224--8590279
22
2.5
22
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0
85
50
12
0
37
1.41
8592200--8592270
31
2.3
32
78
14
85
60
9
1
28
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
2.0
22
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8
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45
2
2
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1.27
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23
2.0
23
100
0
90
44
17
4
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1.69
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25
2.0
25
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3
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26
3
5
63
1.34
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27
2.5
27
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15
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38
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2
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1.29
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26
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8604426--8604524
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28
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1.30
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21
1.98
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46
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28
28
21
21
1.98
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0
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0
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10
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28
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133
2.9
133
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0
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20
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27
1.99
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19
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14
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24
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24
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1.37
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2.0
25
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26
3
5
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1.34
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25
3.1
26
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29
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1.34
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26
4.1
25
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31
9
2
57
1.41
8624189--8624287
25
4.1
23
73
13
67
31
9
2
57
1.41
8624390--8624449
30
2.0
28
84
12
75
36
8
0
55
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8626142--8626186
23
2.0
23
87
12
67
46
0
2
51
1.13
8646718--8646750
15
2.1
17
88
11
52
45
0
6
48
1.27
8647218--8647267
19
2.6
20
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15
52
50
2
0
48
1.12
8647802--8647828
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0
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7
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1
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0
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0
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2.0
35
100
0
142
30
5
26
36
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345