Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  341  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101707126--101707301
46
3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98
101712532--101712617
21
3.8
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23
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2
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1.33
101713474--101713508
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3.2
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11
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0
1.00
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0
2
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0.74
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14
2.5
15
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4
65
16
5
13
63
1.47
101713775--101713812
15
2.5
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12
62
15
5
13
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1.43
101713773--101713846
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2.3
32
84
11
98
12
5
18
63
1.47
101713775--101713843
15
4.5
15
69
26
56
13
5
18
62
1.50
101715213--101715366
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3.0
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886
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32
1.94
101715516--101716075
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3
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31
21
15
32
1.94
101715417--101716075
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3.1
217
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2
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20
15
32
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101727514--101727550
2
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0
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0
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48
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2
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52
7
0
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1.29
101727714--101727765
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0
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0
2
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0
70
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5
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1.9
33
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92
14
6
20
58
1.57
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35
2.0
35
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0
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25
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46
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1.78
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20
2.1
21
82
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62
6
2
27
1.33
101729761--101729790
11
2.7
11
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0
51
60
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
3
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101730301--101730358
18
3.5
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23
56
77
0
8
13
0.98
101730301--101730359
17
3.6
17
75
20
54
76
0
8
15
1.01
101730573--101730623
19
2.8
18
82
5
68
5
0
39
54
1.24
101732438--101732478
16
2.5
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84
11
59
63
0
36
0
0.95
101732445--101732482
3
12.3
3
88
5
58
63
0
36
0
0.95
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114
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2.1
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37
0
6
56
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27
2.3
27
94
0
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25
28
19
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2.1
30
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0
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280
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1.91
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2.9
69
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0
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57
50
5
0
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2.0
29
100
0
116
48
10
0
41
1.37
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17
3.1
17
71
28
59
46
12
0
40
1.42
101752204--101752255
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3.2
15
73
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50
44
0
1
53
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40
0
0
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2.0
22
85
0
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44
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0
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48
0
0
51
1.00
101754013--101754066
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2.5
22
75
6
56
24
22
25
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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60
2.2
60
96
0
252
22
22
20
34
1.96
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2.3
29
82
7
82
19
23
25
32
1.97
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3.1
16
80
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59
63
0
0
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0.95
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58
62
0
0
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2.6
27
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64
64
3
0
31
1.12
101758207--101758398
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2.0
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2
0
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0
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19
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101794295--101794346
23
2.2
24
86
3
70
51
1
0
46
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101796290--101796449
51
3.2
50
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1
239
29
23
14
33
1.94
101799452--101799675
26
9.0
24
71
16
125
57
5
8
28
1.52
101800060--101800137
26
3.0
26
72
7
68
58
2
11
26
1.45
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29
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5
90
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0
8
35
1.29
101802037--101802065
13
2.1
14
93
6
51
55
0
0
44
0.99
101802648--101802688
20
2.1
19
86
4
55
63
4
2
29
1.28
101804788--101804821
18
1.9
17
88
5
50
29
0
2
67
1.05
101806422--101806455
16
2.1
16
100
0
68
44
5
5
44
1.52
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2
19.0
2
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69
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2
0
48
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101806673--101807090
208
2.0
209
93
1
714
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10
39
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101814484--101814532
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23
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2
0
46
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101817648--101817708
30
2.0
30
90
0
95
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9
6
27
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101817742--101817784
22
2.0
22
85
0
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18
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101817749--101817789
11
3.7
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0
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9
14
19
1.66
101825619--101825666
3
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3
100
0
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0
0
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0.92
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
101832121--101832179
29
2.0
29
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9
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45
11
11
30
1.77
101832121--101832200
31
2.6
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11
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1.76
101835597--101835673
26
3.0
26
78
1
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19
5
38
1.74
101841512--101841545
17
1.9
18
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0
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101842904--101842960
2
28.5
2
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7
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40
0
5
54
1.23
101843084--101843215
3
43.3
3
68
20
55
28
4
6
60
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101860385--101860528
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5.3
27
85
3
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28
25
7
38
1.83
101860385--101860528
54
2.7
54
88
0
207
28
25
7
38
1.83
101860560--101860681
27
4.6
26
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5
127
40
18
9
31
1.82
101860527--101860683
80
2.0
80
81
5
183
39
18
10
31
1.85
101860693--101860780
27
3.3
27
73
9
72
39
18
19
22
1.92
101861590--101861659
25
2.8
24
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4
95
24
25
24
25
2.00
101861590--101861686
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23
25
2.00
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0
241
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1.92
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1
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28
1.96
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2.2
40
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2
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30
31
21
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1.95
101865423--101865624
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4.3
47
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268
26
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33
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101868987--101869130
27
5.3
27
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200
29
25
7
38
1.83
101868987--101869130
54
2.7
54
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2
227
29
25
7
38
1.83
101869129--101869291
54
3.0
54
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40
17
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1.84
101869120--101869259
27
5.2
27
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108
39
19
10
31
1.84
101869291--101869353
27
2.3
27
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19
22
22
1.95
101870163--101870233
25
2.8
26
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23
25
22
28
2.00
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42
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0
259
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1.93
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127
29
16
25
28
1.97
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17
2.2
17
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0
58
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0
7
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1.31
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43
24
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25
1.78
101883920--101884041
61
2.0
61
100
0
244
22
19
21
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101886239--101886291
26
2.0
26
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7
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35
1
1
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1.19
101886268--101886304
18
2.1
18
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0
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2
0
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0.97
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2.1
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0
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26
1.90
101887677--101887703
1
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1
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0
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0
0
0
100
0.00
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23
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0
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28
0
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0
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1.89
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1.90
101905689--101905733
2
23.0
2
90
4
74
46
0
2
51
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345