Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  66  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18147595--18147761
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25
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2.0
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10.4
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20
18
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189
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20
17
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1.95
18185961--18186867
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9.7
94
81
4
534
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21
18
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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39
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203
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25
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1.98
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27
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1.99
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119
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27
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24
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18247174--18247324
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19
2.1
19
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15
5
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71
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.99
18251214--18251380
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241
28
22
20
27
1.99
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1.84
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92
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24
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202
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22
21
27
1.99
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1
201
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21
20
28
1.98
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2.0
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2.4
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67
9
15
7
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18289155--18289482
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19
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0
5
50
1.23
18303710--18303750
21
2.0
21
85
0
55
19
26
21
31
1.97
18304927--18305510
193
3.0
193
99
0
1150
33
24
17
24
1.96
18312019--18312051
9
3.7
9
95
0
57
27
0
9
63
1.24
18312077--18312116
17
2.4
17
83
4
55
45
2
5
47
1.38
18312385--18312565
91
2.0
92
80
5
206
31
9
14
44
1.78
18320098--18320125
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
18320312--18320490
66
2.9
60
83
7
189
44
21
16
17
1.86
18320404--18320502
29
3.4
29
68
13
85
43
18
17
21
1.88
18323633--18323675
22
2.0
22
90
0
68
32
0
0
67
0.91
18324749--18324774
2
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2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
18326168--18326252
24
3.4
24
78
12
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30
3
2
63
1.24
18329899--18329932
17
2.1
17
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5
52
64
2
0
32
1.08
18331833--18331992
60
2.7
59
78
8
164
49
15
11
23
1.77
18332211--18332242
2
17.0
2
87
12
50
50
0
0
50
1.00
18332148--18332226
29
2.8
29
69
17
76
40
3
5
50
1.42
18334633--18334684
21
2.6
21
84
6
72
69
7
0
23
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18334636--18334691
21
2.7
21
83
8
62
71
10
0
17
1.14
18336566--18336822
128
2.0
128
96
0
469
27
19
15
37
1.92
18337341--18337400
28
2.1
28
90
0
93
31
30
6
31
1.83
18337510--18337538
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
18342781--18342840
28
2.1
28
90
0
93
31
30
6
31
1.83
18343636--18343694
28
2.1
27
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9
75
42
0
3
54
1.17
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22
3.0
22
73
8
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66
0
0
33
0.92
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18
1.9
17
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58
5
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23
1.55
18352099--18352150
10
5.1
10
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2
59
23
5
1
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1.20
18353577--18353630
27
2.0
27
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0
90
25
33
18
22
1.97
18363846--18363883
13
2.8
13
88
4
58
42
0
13
44
1.43
18363897--18363947
10
5.1
10
85
0
66
23
3
1
70
1.14
18371938--18371984
23
2.0
23
100
0
94
40
8
12
38
1.74
18372424--18372486
30
2.1
30
93
0
108
57
11
3
28
1.49
18374422--18374470
18
2.5
19
80
12
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28
2
4
65
1.22
18375072--18375096
3
8.3
3
100
0
50
0
32
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0.90
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2.1
18
100
0
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5
10
29
1.57
18376710--18376751
22
1.9
22
90
9
68
69
0
28
2
1.01
18383109--18384124
286
3.5
286
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5
1370
27
5
7
58
1.48
18383107--18384124
146
7.1
144
86
5
1366
27
5
7
59
1.48
18384613--18384646
12
2.8
12
95
0
59
0
20
0
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0.73
18384607--18384644
18
2.1
18
90
0
58
0
26
0
73
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18386473--18386586
9
12.0
9
69
18
63
33
1
3
61
1.23
18392434--18392466
5
6.6
5
93
6
50
78
0
21
0
0.75
18392430--18392466
15
2.5
15
83
16
51
75
0
24
0
0.80
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44
2.1
44
85
4
123
22
19
21
35
1.96
18393863--18393964
18
5.7
18
78
0
105
32
13
16
37
1.88
18393871--18393964
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2.6
36
86
0
134
34
12
15
37
1.86
18398491--18398722
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2.4
96
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6
236
42
2
16
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18398768--18399307
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4.3
126
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17
20
27
1.95
18401391--18401519
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3.5
36
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12
147
32
10
24
32
1.90
18408837--18408965
35
3.5
36
82
12
147
32
10
24
32
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345