Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  67  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18412408--18412787
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27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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277
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24
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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18562613--18563037
78
5.5
77
84
6
526
31
20
15
33
1.94
18562618--18563055
225
1.9
228
86
4
632
31
19
16
32
1.94
18562618--18563056
153
2.9
151
86
7
602
32
19
16
32
1.94
18563650--18563683
17
1.9
18
88
5
52
5
20
29
44
1.75
18573291--18573329
15
2.6
15
83
0
51
64
7
2
25
1.33
18573586--18573630
11
3.8
12
82
11
58
57
4
0
37
1.19
18573584--18573630
24
2.0
22
88
8
67
59
4
0
36
1.17
18574569--18574609
17
2.3
18
84
12
50
14
0
41
43
1.45
18577160--18577591
41
10.6
38
84
6
310
30
21
23
24
1.99
18577171--18577592
82
5.2
78
82
7
434
29
21
23
25
1.99
18577210--18577592
124
3.1
122
87
3
513
29
21
23
26
1.99
18577570--18577614
23
2.0
23
95
0
81
13
15
31
40
1.86
18577789--18577814
7
3.7
7
100
0
52
15
0
26
57
1.38
18578698--18578792
46
2.1
46
100
0
190
41
16
9
32
1.81
18578989--18579043
22
2.5
22
77
16
60
23
0
30
45
1.53
18579017--18579056
13
2.9
14
85
7
55
22
0
30
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18580455--18580510
25
2.2
26
78
9
62
37
7
1
53
1.39
18583789--18583925
9
14.6
9
72
8
103
45
20
2
32
1.63
18583789--18583923
57
2.4
57
84
0
171
45
20
2
31
1.64
18589483--18589542
21
2.9
21
84
0
75
28
20
48
3
1.65
18589862--18590291
43
10.4
41
68
18
203
20
19
28
31
1.97
18590016--18590071
28
2.0
28
85
0
76
19
26
26
26
1.99
18590068--18590269
86
2.3
86
84
6
273
21
19
28
30
1.98
18590085--18590310
86
2.6
85
81
6
224
21
21
26
30
1.98
18590216--18590334
42
2.8
41
80
12
100
21
17
27
32
1.96
18593616--18593680
10
7.3
9
77
16
57
66
0
1
32
1.01
18597595--18597633
20
2.0
20
94
0
69
15
23
25
35
1.94
18612058--18612098
21
2.0
21
85
0
55
39
19
17
24
1.92
18615874--18615963
9
9.3
10
74
12
64
64
3
1
31
1.17
18615874--18615963
19
4.7
19
71
15
69
64
3
1
31
1.17
18616159--18616222
29
2.3
28
75
15
71
31
4
0
64
1.14
18617852--18617877
9
2.9
9
100
0
52
57
7
0
34
1.27
18622683--18622729
23
2.0
24
84
12
62
51
2
2
44
1.25
18623906--18623943
19
2.2
19
86
13
55
42
0
2
55
1.14
18631838--18631886
22
2.3
20
83
13
55
57
0
2
40
1.10
18631857--18631900
22
2.1
21
87
8
63
54
0
9
36
1.32
18633882--18633922
16
2.5
17
88
11
59
26
2
4
65
1.25
18645404--18645669
132
2.0
131
79
3
284
36
18
16
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18648189--18648219
15
2.1
15
100
0
62
67
0
12
19
1.22
18660477--18660561
41
2.0
42
86
2
118
23
21
21
34
1.97
18660589--18661330
88
8.4
88
81
3
816
24
24
18
32
1.97
18660571--18661330
176
4.3
177
90
1
1116
24
24
19
31
1.98
18660876--18661275
44
9.1
44
62
16
157
24
25
19
31
1.98
18663144--18663200
1
57.0
1
78
0
51
3
0
8
87
0.64
18663157--18663201
8
6.0
8
80
15
60
0
0
13
86
0.57
18663155--18663200
15
3.1
15
87
6
67
0
0
10
89
0.50
18663160--18663205
14
3.2
14
90
3
65
0
0
15
84
0.62
18663157--18663205
23
2.1
23
88
0
71
0
0
14
85
0.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345