Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  108  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29016827--29016876
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29
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2.1
216
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620
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19
15
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.0
20
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52
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17
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.99
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42
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142
23
18
26
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29190625--29190651
13
2.1
13
100
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33
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29
1.85
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3.2
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2.2
19
83
12
50
58
2
0
39
1.11
29212809--29212836
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
29216853--29216947
47
2.0
47
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0
109
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6
4
31
1.43
29217691--29217724
15
2.2
16
89
5
52
44
0
0
55
0.99
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21
2.7
21
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13
73
57
0
8
33
1.29
29219274--29219365
31
3.0
30
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114
48
0
2
48
1.13
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18
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20
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7
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0
8
44
1.34
29221649--29221703
19
2.9
18
78
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1
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41
1.46
29229476--29229537
13
4.8
13
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54
37
4
20
37
1.75
29229476--29229539
26
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26
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20
37
1.74
29230395--29230428
10
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10
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38
0
0
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33
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1.58
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22
1.9
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48
1.44
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23
1.9
23
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0
4
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1.02
29243522--29243546
7
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7
100
0
50
12
16
0
72
1.13
29247987--29248096
40
2.7
40
82
12
136
25
15
26
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
20
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64
2
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27
1.28
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27
2.0
27
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0
99
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0
24
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1.40
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40
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11
147
26
14
24
34
1.94
29259380--29259416
19
2.0
19
85
15
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29
13
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20
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28
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1.8
93
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0
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20
21
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1.98
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3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
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1.8
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0
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1.98
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2.4
40
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1.93
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1.83
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22
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0
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0
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0
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0
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1.15
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0
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2.3
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0
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2.0
21
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0
0
62
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0
0
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14
5.3
15
71
24
64
39
0
1
59
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29280758--29280787
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15
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0
0
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1
1
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1.13
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17
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37
3
0
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5
0
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0
0
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0
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29282242--29282284
18
2.3
19
84
8
61
20
6
2
69
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345