Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  331  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
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4
153
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1.93
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16
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112
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99030393--99030823
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31
22
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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12
100
0
54
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44
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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13
27
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
99177140--99177281
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2.4
18
88
0
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13
13
38
1.84
99183243--99183346
21
4.9
21
80
2
100
37
26
21
14
1.92
99183241--99183349
42
2.5
42
91
2
173
37
25
21
15
1.93
99184783--99184818
15
2.3
17
81
18
51
0
30
0
69
0.89
99194861--99194931
34
2.2
34
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7
85
42
21
25
11
1.86
99216543--99216586
23
1.9
23
95
0
79
43
25
13
18
1.86
99217651--99217793
25
5.8
24
70
7
90
20
26
19
33
1.96
99217749--99217810
25
2.5
25
82
7
74
20
25
22
30
1.98
99217651--99217793
74
1.9
74
82
2
180
20
26
19
33
1.96
99217651--99217813
74
2.2
74
81
2
175
21
26
19
32
1.97
99217772--99217831
25
2.4
25
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10
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25
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30
1.99
99225387--99225429
18
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18
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46
0
0
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1.00
99227513--99227547
2
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0
0
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1.00
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7
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5
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5
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0
106
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0
0
39
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33
2.6
33
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3
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25
29
17
27
1.98
99229451--99229683
117
2.0
117
89
1
360
29
24
12
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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68
0
31
0
0.89
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29
1.9
29
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10
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5
33
1.55
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13
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0
0
26
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18
2.4
18
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2
0
53
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3
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1.87
99250877--99250944
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1.85
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21
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0
0
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0
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0
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3
100
0
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0
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0
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4.5
8
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0
11
2
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99263401--99263435
15
2.2
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0
11
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1.8
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27
1.98
99264188--99264347
43
3.9
42
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159
31
17
24
26
1.97
99264426--99264506
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2.5
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4
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20
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1.58
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21
2.6
21
74
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58
1
43
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34
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99265206--99265234
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2.1
14
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51
58
6
0
34
1.25
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8
163
31
11
24
32
1.91
99269322--99269492
75
2.4
75
84
7
212
31
11
23
32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99272391--99272444
9
6.0
9
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0
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1
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1.57
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18
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0
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1
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24
2.7
24
77
11
73
14
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22
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99274017--99274075
25
2.4
24
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0
0
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0
0
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5.3
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13
50
20
0
2
76
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345